喬伊像個巨大的熔化器，所有他周圍的金屬都會很快熔化。他身體出現的異能，不但讓路人恐懼，也讓他自己感到莫名其妙，并且害怕。這時，一輛車停在他面前，黑色行動隊出現了，這些人用槍對準了他，并讓他舉起手來。還沒等喬伊有進一步的反應，他們手里的槍已經開始熔化，喬伊趁機逃走，躲在小巷里。但很快喬伊又被黑色行動隊的人發現了，正驚惶失措，黑色行動隊的人突然像被狂風吹跑了，原來是神盾特工隊趕到了，他們及時救下他來，神盾特工隊的黛西，就是斯凱，她現在改名叫黛西。她說服了喬伊跟他們走，并讓他進了一間封閉房，這間房突然騰空而起，將他帶到了神盾局的空中飛行器中。
隨后，黛西向喬伊解釋了發生在他身上的怪事，因為她也曾經歷過同樣的事，也擁有著異能。
菲爾在拍下黑色行動隊幕后神秘女人后，也趕了回來。他跟黛西慶幸著總算救下了第一個異能者。因為前面五個都被黑色行動隊劫走了。
芭比為喬伊安排了新房間，并且告訴他這兒的人不會傷害他，他也傷害不了這兒的人。
菲爾和同事們研究著那神秘女人的來歷。
黛西和邁克來到喬伊的房間。黛西進一步向喬伊解釋了出現在他身上的特異現象，因為他身上已擁有了部分外星人的基因并被泰瑞根激活，黛西說，歡迎加入我們異人族。
喬伊不敢置信地笑了起來。但當黛西說他不能再回到以前的生活中了，喬伊發怒了，邁克手里的金屬板熔化燙了他的手，黛西只能出手先將喬伊擊暈。
菲爾讓芭比打電話叫菲茲回來。菲茲卻不肯馬上回來，他正在摩洛哥查線索。他失去了愛著的女人西蒙斯，所以想查清巨石的屬性，聽說那塊石頭被埋在了尤卡坦，石頭旁的卷軸盒里有張羊皮紙，解釋了這塊石頭的屬性。但被約瑟夫的黑社會組織搶劫帶走了，所以，他要找到他來交換，他被綁著見到了約瑟夫，不顧付出生命的代價，搶走了羊皮紙逃掉。
菲爾按芭比提供的線索找到了那神秘女人，不料她早有防備，并反過來抓捕了他。她說自己叫羅莎琳。羅莎琳去接電話了，菲爾才有機會逃脫。
黛西和邁克去找林肯幫忙。林肯也是異人族，但他不想回來。正爭執時，突然出現了一個殺異人族的怪物，三人合力才將怪物擊退。但林肯的正常生活也毀了，有同事看到了他的異能，打了報警電話。因為正常社會對異人族也是追剿的。他依舊不肯黛西邁克回去，獨自狂奔而去。
菲茲回來了，他滿懷希望地打開羊皮紙，卻發現只用希伯來文寫著一個詞死亡。菲爾勸解他要跟過去道別，他嘴上答應了。但后來卻獨自打開了一直封閉著的巨石，沖著它絕望地大吼。
同事們發現菲茲闖進了巨石封閉室，急忙趕去，將他及時拉出來，又封閉了巨石。這時，菲茲發現自己手上有砂，這砂看起來很尋常，但卻比地球上的早十億年。神盾特工隊的人一起猜測，這巨石應該就是個傳送門，通往宇宙的另一星球，而西蒙斯應該是被帶到了那里，她還有活著的希望。新的發現讓特工隊的同伴們迅速行動起來了。
亨特一直記著要抓回沃德的事，他打算潛入九頭蛇，伺機復仇。正是因為沃德那一槍，為了保護自己，女友芭比被轟掉了半個肺，差點送了命。芭比也想去，但她還沒有傷愈，亨特不想女友再冒生命危險卷入這件事。
亨特設法找到了梅，她也同樣對沃德懷有仇恨。亨特請她為他弄個假身份，然后打入九頭蛇內部。沃德正在設法奪取九頭蛇的權力，他帶人抓住了九頭蛇前領袖的兒子沃納，用各種方式逼迫他妥協。沒想到沃納并不像他想的那樣孬種，始終不肯妥協。兩人選擇了合作，重建九頭蛇組織，并使其發揚光大。
菲爾和隊友們，請來了蘭道夫教授加入。果然，蘭道夫從羊皮紙上發現了端倪，帶著他們，一起前往英國查探巨石情況。他們趕到了那所城堡，找到了那處刻字的所在，緊接著，暗藏的通道被他們發現了，他們順著通道走了很久，借著手里的手電筒光線發現，他們像是來到了一所奇怪的地堡，最終，他們發現了深坑，大家猜到了這個深坑是用來放巨石的。
黛西也請了加納博士幫忙，想讓喬伊加入神盾局。加納發現了黛西身上的領袖特質。她作為異人族，很想找更多的異人族，利用他們與眾不同的能力，跟神盾局的人合作。
黛西和邁克也趕到了地堡，和菲爾他們會合。大家啟動了地堡中的設備，深坑忽然有了反應，發出巨大的脈沖聲，將黛西震暈了過去。其它人卻都沒什么感覺。而菲茲從中發現了辦法，黛西用自己的超能力打開了傳送門，菲茲跳了進去，在另一端找到了西曼斯，并成功地救回。
林肯施展異能，總算逃脫了黑色行動隊的追捕。但黑色行動隊所屬的ATCU組織將他的照片和信息全國發布，稱他是外星殺人犯。露西打電話給林肯，想幫助他。可林肯馬上掛斷電話，并摔碎手機，去掉了身上被神盾局埋下的聯絡跟蹤器。
亨特和梅去找能幫他們聯系到九頭蛇組織的斯巴德，探聽到了有用的信息。
西蒙斯重返之后，由于長期呆在了另一個星球，身體機能發生了一系列變化。為了幫她恢復，菲茲帶她去實驗室轉轉，結果當她看到曾用來做傳送門的巨石，現在雖已經碎裂成一堆石頭，還是產生了反應，她曾經最愛的實驗室也讓她感覺不適。大家知道她有很多事沒有說出來，比如，她是如何獨自在另一個星球活下來的。但大家尊重愛護她，決定等待，到她自己想說的時候再聽。
林肯躲到了一個朋友家，但當朋友從電視上得知他就是那個外星殺人犯，于是打了熱線電話。林肯逃跑時他因受到了驚嚇而死，林肯感到十分內疚。林肯打電話給黛西，訴說了自己的心境。
菲爾約了羅莎琳見面，她就是政府的秘密組織ATCU的總負責人，她所領導的黑色行動隊總是在異能人出現的時間趕到，并將他們帶走。神盾局的人懷疑他們將這些異能人殺害并研究，美其名曰為了給國民以安全感。這次見面，菲爾想勸她同意神盾局將林肯帶走，但羅莎琳還是拒絕了。菲爾還想請求她一件事，不要透露出黛西的信息，他知道羅莎琳手里有張醫院的照片，如果她將之公布，黛西的安全也將受到威脅。
黛西和邁克趕到去營救林肯，黑色行動隊的人也到了。黛西想說服他不要再陷入對朋友之死的內疚，跟著她走。她表達了一直以來對他的愛情，當黛西成功說服林肯，準備帶他撤離時，邁克進來告訴她計劃有變，菲爾讓把林肯交給黑色行動隊。林肯再次使用異能逃脫。當黑色行動隊又準備對付黛西時，菲爾選擇了以后跟他們一起合作做為條件，才保全了黛西。
菲茲帶西蒙斯去吃他精心準備的浪漫晚餐。西蒙斯突然哭了，菲茲摟住她安慰著。她離開得太久，有很多事需要重新適應。
亨特和梅經過一輪輪血腥殘酷的殺戮，亨特最后被帶到了總部，他將被安排與沃德見面，這正是他們此行的目的。