戈登因為行為不當被踢出了警隊,目前成為了哥譚市的一名賞金獵人。一天夜里,戈登在大街上走著,突然遇到一只背上張刺的彪形大漢,正在襲擊一家藥店。戈登聞到了金錢的味道,二話不說立即出手。雖然戈登在體型和力量方面稍遜一籌,但彪形怪人沒什么腦筋,光顧著攻擊戈登,沒注意到從旁駛來的大卡車,出其不意地被撞到在地。新的一筆酬金又到了戈登手上。
菲什帶領了一幫怪人從阿卡姆的實驗室逃走后,打算重整旗鼓后再奪哥譚之巔。好不容易在哥譚建立了自己勢力的企鵝人科波特對菲什十分痛恨,但菲什的生命力比他想象中的更加頑強,科波特不得不采取非常手段去除掉她。
芭芭拉和塔比沙目前經營著一家高級餐廳,但這只是表象。她們現在經營著黑道生意,并接一些暗殺業務,科波特就此和芭芭拉搭上了話。芭芭拉知道科波特目前在哥譚的地位非常高,衡量利弊后,她決定跟科波特交個朋友,賣他一個人情。兩位性格怪異的哥譚狂徒惺惺相惜,科波特拜托芭芭拉幫他找到菲什,無論死還是活。
哥譚城內多處藥店出現了被怪人襲擊的現象,警局順藤摸瓜,查到了一些端倪。這些怪人都在找一種藥,這種藥是可以克制雨果在菲什身上做實驗的變異后遺癥,也說明了,就是菲什組織大批怪人,在尋找這種藥。
瓦萊麗是一名出色的記者,也是一名為了新聞可以不擇手段的人。她為了挖掘哥譚的丑聞,故意接近戈登。無論她對戈登的好是真是假,她都成功吸引到戈登的注意了。畢竟戈登剛剛失戀,他的前度女友湯普金斯醫生離開他以后,結交了新的男友,準備嫁做人婦了。
瓦萊麗跟戈登交易,她手上有菲什的情報,但要求戈登向她透露警方的行動信息,以便自己能獲取警方大戰怪人的一手資料。戈登不知是受不住抓捕菲什的誘惑還是瓦萊麗的誘惑,他同意了。
科波特如今勢頭大好,但是他的好朋友謎語人尼格瑪還被關在阿卡姆。當時,性格孤僻的科波特被人差點弄死,是尼格瑪救了他。在科波特最難過的時候,只有尼格瑪陪他說話。對待友情異常耿直的科波特把尼格瑪視為知己,他決定要把這個好朋友從阿卡姆救出來。
戈登在一處制藥廠找到菲什,兩人進行了一番激戰,但依舊讓菲什溜走了。
布魯斯·韋恩被雨果捉到印第安山時差點沒命,事后他離開了哥譚一段時間,為了安全,也為了特訓。印第安山是韋恩家族的產業,但自己卻差點在自己的地方殞命。布魯斯覺得這一切都事有蹊蹺,這次他回到哥譚,決定把插手自己家業的老鼠揪出來。
菲什現在的身體狀況越來越糟糕,她于是抓到雨果的助手埃塞爾,打算讓她修復自己。但埃塞爾表示,自己也無能為力。菲什在牢里沒少受埃塞爾的“招待”,如今這個女人對自己已經毫無用處了,菲什揮一揮手,手下便讓埃塞爾去了見上帝。
賽琳娜此時在菲什身邊做小跟班,她目睹著這一切的發生,早已見怪不怪。就在賽琳娜以為今天的混亂要結束時,她的好朋友艾薇卻被人捉到菲什面前。菲什認為,這個女孩是敵方勢力派來的探子,但艾薇只是好奇賽琳娜這幾天不知道去哪了,才跟蹤至此。無論艾薇出于任何目的,她知道的東西太多了,菲什不能留她,只好命人對她痛下殺手。艾薇趁人不備時立即逃走,隨后遭到追捕,賽琳娜也緊隨其后,希望能制止這場誤會。艾薇不勝腳力,被人追上了,一不留神便失足掉進了一個水渠。賽琳娜沖上前一看,艾薇已不見蹤影。
布魯斯·韋恩逐漸成長,對待那些想要禍害自己集團的人,態度也開始強硬起來。雨果教授在印第安山時進行的非法實驗,實際上是受到一個神秘組織在背后操控。布魯斯發現,這個組織就潛伏在自己的集團內,對自己的家業造成巨大的威脅。
布魯斯那種超出年紀的冷靜果斷,在集團會議上給其他人帶來了一定的震懾力,也引起了神秘組織的戒心。布魯斯被神秘組織擄走了,阿爾弗雷德寡也被打倒受了傷。布魯斯被帶到一處大宅里,一個戴著面具的女人正對著他微笑。布魯斯知道這人不懷好意,因此一改自己的紳士教養,直接開門見山與她談起條件。這個女人叫凱瑟琳,她摘下面具時,布魯斯對她的臉有印象,因為他在好幾次的集團、家族活動上都見過她。布魯斯細思極恐,這些邪惡的事業一直在韋恩集團里潛伏著,而自己卻毫不知情。
凱瑟琳以布魯斯身邊之人的安危作為交換條件,逼他停止對組織的調查,并交出集團的實權。對于布魯斯來說,家人、朋友就是他的軟肋,無奈之下,他只好就范。
艾薇掉進下水道后,發生了怪事。受了傷的她,被路過的男人救了,隨后,她發現自己的身體產生了變化。艾薇從一個毛丫頭,突變為一個成熟的、身材極好的美貌女子。這種轉變雖然十分詭異,但艾薇卻覺得這是她人生的轉機。艾薇不僅身體產生了變化,她還獲得了操控植物的能力。
菲什和一批怪人早前被哥譚警局圍剿過,但警力不足,菲什等人再一次從警方手中溜走了逃脫了。企鵝人就這件事借題發揮,因為他之前成功把菲什從哥譚趕走,他認為政府、警方都是無能的,自己才是哥譚之王,自己才有能力保護哥譚。企鵝人的當眾演說獲得了眾多市民的認可,大伙兒紛紛都把他當成哥譚的新英雄,是大家的領袖。
菲什來到囚禁雨果的監獄,想向他拿解藥,治好自己的身體問題。布洛克帶領警方圍剿菲什時,被菲什反擒。戈登為了救布洛克,親自上門跟菲什交涉,他知道,菲什只是想要藥,還有脫身的機會。但現在雨果表示他無法一下子交出解藥,他需要時間。
企鵝人帶了一大群人來參與這場騷動,他想借此機會向大伙兒證明,哥譚警方的無能,只有自己才能救哥譚。戈登為了救布洛克,與菲什達成了交易,就是讓她和雨果趁亂從后門的樹林逃走,菲什便答應放過布洛克。但戈登不打算放虎歸山,他也知道企鵝人的實力,于是給企鵝人通風報信,讓他在樹林處守著,隨時對菲什進行伏擊。
菲什按照原定的計劃準備逃脫,但企鵝人早就已經在樹林等著了。企鵝人再次見到菲什,隨即把心中的憤怒宣泄一番,但菲什當時在大橋下,并沒有殺死他,這個謎題一直在企鵝人心中揮之不去。為什么菲什當時不殺了他,如果企鵝人在那一晚死了,那么他們現在就不會有如此的下場了。菲什此刻一改平日驕橫跋扈的姿態,而且以憐愛的眼神看著企鵝人。企鵝人是菲什的作品,是她的打傘小弟。企鵝人變成現在這個樣子,讓她有種驕傲的感覺。企鵝人動了惻隱之心,放了菲什一馬。
布魯斯平安回到家里,阿爾弗雷德總算放下心來。雖然要面對的問題很多,但布魯斯一直在成長,阿爾弗雷德相信少爺有足夠的能力應付。就在兩人思考下一步計劃時,家里突然出現一個男孩,這個男孩的外形跟布魯斯一模一樣。
布魯斯讓假布魯斯暫住在家里,給他溫飽。假布魯斯不知道自己是誰,只知道菲什把自己從雨果手中救出后,便逃到哥譚。此后他一直四處流浪,直到有一天,他在賽琳娜的天臺那里,看見了布魯斯,才對自己的身份產生懷疑。阿爾弗雷德與假布魯斯相處下來,發現他性格跟布魯斯十分相似,格斗術十分出色,這不難想象,這個假布魯斯,是神秘組織讓雨果做的復制人,這當中可能隱藏著什么陰謀。
哥譚城中出現了一名催眠魔術師——杰維斯·泰奇。他能夠控制人心,讓人在催眠的狀態下,做出意想不到的行為。他在芭芭拉的酒吧進行了一場精彩的表演,吸引了眾人的注意,一時之間,成為哥譚城中炙手可熱的魔術明星。但是他的目的不只是要名和利,在他的內心,有更加黑暗的計劃。
杰維斯找到戈登,要求他幫忙找到自己的妹妹愛麗絲。杰維斯和妹妹父母早亡,兩人相依為命。愛麗絲的血液里含有毒素,杰維斯為了治好愛麗絲,把她送到雨果教授那里,沒想到,這一送就是把妹妹推進了火坑。愛麗絲在之前的一次騷動中逃脫了,目前下落不明,他出高于警局的價錢委托戈登,希望他能夠幫到自己。
戈登從塞琳娜口中知道愛麗絲現在打工酒吧,于是前往查探。愛麗絲在她打工和暫住的地方引起了混亂,惹來了眾多仇家。戈登順藤摸瓜,終于見到了愛麗絲。正當戈登打算制服愛麗絲時,他發現愛麗絲并不像她哥哥那般渴望兄妹團聚。愛麗絲害怕杰維斯,她懇求戈登,不要把自己的下落說出去。
企鵝人科波特不僅僅要做哥譚的無冕之王,他還希望實際在哥譚獲得實權,于是,他決定參與競選市長。企鵝人先是用武力,威脅原來的市長,讓他不要跟自己爭奪這個位置,隨后他來到阿卡姆瘋人院,利用職務之便,讓院長把尼格瑪釋放出來。他的身邊,需要一個忠誠的戰友。
戈登覺得事有蹊蹺,于是質問杰維斯到底怎么回事。原來杰維斯早就接了芭芭拉的委托,芭芭拉想要杰維斯把戈登帶進地獄。就在戈登被杰維斯催眠,走到高樓的邊沿時,愛麗絲突然出現,她舉槍指向杰維斯,把他趕跑。戈登在吵鬧中清醒過來,可惜一個不留神便失足掉了下樓,就在這千鈞一發之際,愛麗絲伸手把他拉了上來。愛麗絲救了戈登,但戈登掏出手銬,把愛麗絲帶回警局領賞。
假布魯斯流落街頭時,無意中獲得了塞琳娜施舍的金錢,而當他知道布魯斯和塞琳娜的關系后,便對這個女孩產生了奇怪的想法。一天夜里,他從布魯斯家里偷走了一輛勞斯萊斯,然后不辭而別。假布魯斯找到塞琳娜,約她出去兜風。