自從由雨果·史特蘭奇靠非法實驗復活的實驗對象，在死而復生的費雪·穆妮帶領下逃脫后，城市在半年期間出現多個瘋狂事件。戈登因為愛人移情別戀而拋棄了警察職務，開始在各處搜捕怪物來討生活，認為以此可以彌補心中的愛情殘缺。另一方面，自從希歐·蓋勒文帶著罪孽身亡后，奧斯瓦德找準時機奪下了市長職位，受部分無政府市民愛戴時也得到部分人的不滿。一個神秘催眠師杰維斯·泰奇蒞臨了城市，并因為一些恩怨而和戈登成為死對頭，他瞄準了戈登心中對愛人的愧疚作為武器，屢次將戈登逼入絕境。而一個邪教組織通過跟雨果相同的技術，復活了轟動一時的瘋“笑”罪犯—杰羅姆·沃洛斯卡，使城市的安危再一次受到威脅。所有人在對抗彼此的同時，卻不知一個掌控城市長達幾世紀的神秘團體，已經準備好對城市進行“凈化”以清除罪惡根源。