姜子牙得知土行孫心念鄧嬋玉，遂答應他只要勸降鄧九公，就成全他與鄧嬋玉的婚事，土行孫大喜過望，誠心歸降。散宜生利用與鄧九公的親戚關系，只身一人前往商營為土行孫說媒。鄧九公表面同意婚事，實則暗中安排刺殺武王和姜子牙。周武王與姜子牙早已識破鄧九公的陰謀，索性將計就計，主動率楊戩等眾將進入鄧九公所設之局，反擊鄧九公，混亂中鄧九公拼死出逃。土行孫奉命救出了哪吒和黃天化，后又用捆仙繩綁了前去平亂的鄧嬋玉，硬是把她搶回了周營。鄧蟬玉以淚洗面，拒絕婚事。

周將無奈，只請得蘇夫人前去勸說。情勢所逼，鄧蟬玉只能就范，嫁與土行孫，但有一條件：土行孫要變高。土行孫在師父、師叔及眾師兄的撮合、幫助下，終于如愿長高許多，卻因此而失去地行術的本領，鄧嬋玉深受感動，與之喜結連理。

鄧禪玉以西周將帥之名出使商營，對父親鄧九公苦口婆心，言明利害，并澄清自己是自愿嫁與土行孫。鄧九公對女兒抱以歉疚之心，最終在女兒的勸說下決定棄暗投明，反紂歸周。消息傳到朝歌，以為邊官有捷報的紂王翻閱奏折，立馬氣得口吐鮮血，暈倒在地。心系紂王的狐妲己急召申公豹商量對策，妲己命孔宣為帥，剿滅叛賊。另一方面申公豹決定先擒武王以阻擋周軍東進。兩方雙管其下。

這日，孔宣與汜水關守將韓榮共商抗周大計。申公豹施毒計，將武王挾持，丟入山崖之下。被山下淳樸的村民救起。申公豹用激將法請來瘟疫鼻祖呂岳向山村散播瘟疫，使山村的百姓的性命危在旦夕。愚昧的村民因此遷怒于從天而降的武王，認為是他帶來了瘟疫，不敢透露身份的武王姬發(fā)被鎖進豬籠。倒是郎中之女子魚始終對姬發(fā)呵護有加，不離不棄。紂王長子殷郊不忍殷商江山成為大周土地，不顧師父廣成子好心相勸，違背師意，偷了師父的鎮(zhèn)洞之寶番天印、落魂鐘和雌雄劍，偷偷下山，并發(fā)誓：廢除紂王，重振殷商！途經白龍山，遇溫良、馬善兄弟，后三人又孔宣、韓榮會合。金雞嶺下，兩軍對陣，殷郊攜溫良、馬善用落魄鐘術生擒了黃飛虎父子。

殷郊得知黃飛虎就是自己多年之前的救命恩公時，念及舊情，將黃氏父子放回周營，算是知恩圖報。子魚偷出鑰匙，救了化名仲發(fā)的姬發(fā)。他們拖著病體歷盡艱辛，向黃龍真人求得仙藥，黃龍真人盛贊姬發(fā)、子魚為救百姓，舍己為人。依黃龍真人的囑托，姬發(fā)、子魚拖著病體在洞府內搗藥，黃龍真人下山救人。姬發(fā)、子魚搗藥時因體力不支而累倒，沒想到正是他們搗藥時散發(fā)出來的藥氣，救了他們的性命。兩人醒來后發(fā)現(xiàn)玄機，急忙捧著藥罐下山就村民。村民們感激涕泠，對他們曾經關押武王進豬籠深感內疚。

武王失蹤后，周軍一時群龍無首，?姜子牙讓楊戩變作武王行事，以安軍心。次日，姜子牙讓黃天化引領著殷洪與其兄殷郊共敘舊情，二人抱頭大哭。但因兩人的立場不同，殷郊翻臉欲強行要帶前去勸降的胞弟殷洪回營，殷洪苦口婆心的試圖勸服殷郊皆未果。遭到殷郊的軟禁。黃天化與殷郊交戰(zhàn)，不料被被殷郊用番天印擊中頭頂當即身亡。面對黃天化的尸體，黃飛虎痛不欲生，情急之下口吐鮮血，不省人事。姜子牙見黃飛虎父子情深，父慈子孝，深受感動。姜子牙領著黃飛虎與黃天化的魂魄趕到封神臺，把已故的黃天化封為三山正神丙靈公。黃飛虎見其子能得成正果，倍感欣慰，原神回到陽間。