Finch征召Reese加入POI團隊之前的秘密及他從事過的任務終于曝光——過去的秘密與現在發生的一系列事件之間存在驚人的聯系。

機器指派Root尋找有神秘背景的看門人Cyrus（Yul?Vasquez），但Root的出現導致此人面臨生命危險。與此同時，Finch也收到了此人的號碼，他與Root的沖突不可避免。Colin?Dennell扮演一名被轉運的囚犯，他的世界與Root產生了交集，但他不知道原因。他后來成為Root的大計劃中的「重要棋子」。

Finch和Reese獲得的新號碼來自一個前政府項目承包人，而此人正在秘密跟蹤一個聯合國外交官。Finch和Reese必須學會與國際政治圈中的人物打交道，但這里面的水太深了，他們有些難以招架。與此同時，一個敵人試圖用卑鄙的手段在與Root的較量中占得上風。