慈禧率眾妃到廟中禮佛，光緒與珍妃在廟外跪拜，請慈禧停止向聯軍宣戰，慈禧覺得光緒向西洋諸國屈服，不配為人君。光緒愿退位讓賢，以請慈禧收回成命。慈禧以為光緒受珍妃唆擺威脅她，命人掌摑珍妃，光緒哀求至吐血暈倒。懷安向杜仲單打，認為有人多管閒事，引起光緒關注外間事，使他未能安心靜養。1900年八國聯軍攻入北京，載漪和載灃接慈禧離宮西狩，玉貴到瀛臺接走光緒，但獨留珍妃在北三所，光緒囑杜仲接珍妃跟上大隊。

伏苓留下珍妃躲藏?

杜仲帶珍妃和伏苓離開紫禁城，遇上英軍殺入。杜仲指珍妃和伏苓是宮女，才獲英軍放行。紫禁城到處被聯軍擄人放火，杜仲要伏苓帶珍妃往小屋躲藏，他則去救其他宮女。葛根返存仁館保護各人，金贊到杜家接走百合。伏苓和珍妃等了一段時間，尚未見杜仲回來，伏苓決定外出找杜仲，留下珍妃躲藏。伏苓在宮中遇見到一聯兵穿朝服的男子，以為是杜仲，奮不顧身拯救，冷不防聯兵從后刺殺伏苓，這時杜仲撲出擋了一刀。二人趕返小屋，珍妃已不知所終。德齡到存仁館找葛根，卻被鐵骨脅持走入存仁館躲避洋兵追殺。?

杜仲伏苓各懷心事?

杜仲邀伏苓到家中暫避，兩人閒聊，講述她當年與鴻儒離開北京到廣州，因生活逼人，伏苓也外出打工幫補生計，直至有晚下班回家不見鴻儒，他留書謂不能再吃苦，此后她再沒見過他。杜仲讚賞她曾有一段轟轟烈烈的愛情，伏苓卻羨慕他與百合無風無浪過日子。半夜，伏苓與杜仲各懷心事，伏苓拿著玉珮嗟嘆下半生要孤獨終老，無聊下拿起杜仲的醫書翻閱，竟找出杜仲寫的詩，想起當年離開杜仲的情景，令她增添幾分愁緒，時杜仲送厚被給伏苓保暖，伏苓的手無意中觸碰杜仲，杜仲也添惆悵。翌日錫庚找杜仲返太醫院收起藏書，這時日軍大佐領兵進駐，他要御醫交出《青囊書》。

杜仲救治日帥槍傷?

杜仲向大佐推薦錫庚能默寫《青囊書》內容。杜仲要錫庚將他多年行醫心得寫出來，既瞞天過海，又可拯救太醫院各人。伏苓等候杜仲多時尚未見他出現，折返太醫院，只見數位太醫，獨不見杜仲，擔心他有意外。待大佐出現時，伏苓向大佐襲擊，混亂間槍傷大佐，伏苓被副官擒獲。杜仲和錫庚已默寫完醫書走出房間，看到大佐流血不止，杜仲請纓為大佐做手術，但要保證不可傷害各人。杜仲憑著他曾看過泰來神父做手術，成功取出子彈，大佐手術成功身體無恙。大佐答應放過太醫院各人，唯獨用槍指著伏苓……

大佐見杜仲甘愿自我犧牲，有情有義，決定放過伏苓和太醫院所有人。杜仲邀伏苓返家躲避聯軍，二人在家有說有笑，忽然見百合因為擔心杜仲安全而返家，杜仲除驚喜外，更因伏苓在家而尷尬。百合見伏苓后面露不滿，伏苓也匆匆離開。百合故意向杜仲打探當年逃婚妾侍的去向，杜仲支吾以對。百合在書房發現留下的被鋪染有口紅印，覺得杜仲有事隱瞞。

百合得悉伏苓身分

瑜貴妃和軍機大臣商議政事，商討聯軍提出的議和條件，載灃向鴻章冷嘲熱諷，令鴻章胃痛發作。朝臣退下，瑜貴妃情不自禁要跟載灃親暱卻被拒絕，要她忍耐直至他登上皇位。秋萍無意中問起伏苓推拿的事，令百合懷疑。及后百合于大街暗角躲藏時，偷聽到明珠和何青大談伏苓與杜仲再生情愫，驚悉伏苓就是當年逃婚的妾侍。

載灃得悉瑜貴妃召見德齡后，匆匆入宮找她算賬，瑜貴妃說明她得不到的，別人也休想得到。德齡將翻譯文件交予瑜貴妃，瑜貴妃故意要幫德齡做媒，有意令載灃難堪。杜仲到王府請載灃幫忙找珍妃，之后匆匆與伏苓會面，原來一切竟是由百合安排!

伏苓杜仲天意弄人

百合揭穿杜仲和伏苓早已相認，只有她被蒙在鼓里，認定二人一同背叛她。杜仲和伏苓不約而同向百合發毒誓，表示從沒有背叛她。伏苓下了決定，與杜仲劃清界線。杜仲安頓好百合后，獨自到書房看到自己曾寫下的詩，發現多了「天意弄人」四個字，知道是伏苓寫的，傷痛下便把詩燒毀。

鴻章簽下辛丑條約，慈喜和光緒即將從西安返回紫禁城。杜仲有意辭去太醫院工作陪伴百合，百合聽到感心甜。七叔催促伏苓找出宮中內應，伏苓不想再與杜仲在宮中碰面，有意推辭工作，七叔曉以大義勸她要以革命為重，伏苓無奈繼續追查。

玉貴被俘珍妃失蹤

杜仲未能尋找珍妃自覺失職，向光緒請辭，光緒反要他留下盡力尋回珍妃。原來在慈喜出走西安時曾經遣玉貴回宮找尋珍妃。載灃從聯軍俘虜名單中找到玉貴，卻無珍妃在內。玉貴向慈喜和光緒稟報，當他返回紫禁城后即被聯軍囚禁大牢，繼而不知珍妃去向。

御醫報告太監和嗎嗎出現屙嘔征狀，杜仲懷疑水源問題，他與錫庚調查多個水井未有發現，錫庚在其中一個水井發現死尸，杜仲觀察死尸已發脹，推測此乃井水受污染的源頭，杜仲再仔細觀察死者的衣服，覺得似曾相識……

載灃向慈禧稟報珍妃死於井底之內，大家猜測珍妃怕受洋人凌辱投井自盡，但杜仲不信她投井輕生，慈禧禁止各人向光緒洩露珍妃已死。七叔要伏苓盡快查出內應和有關朝廷潛伏組織里的J細名冊。杜仲落井底找尋珍妃死因線索，發現井底墻壁有抓痕，他推測珍妃曾掙扎過，最終力竭而沉沒。他又從載灃的俘虜名單中，發現玉貴被捕的日期正是珍妃失蹤兩日之后。

玉貴強搶珍妃珠鏈

葛根找玉貴喝酒，其實是載灃要他向玉貴打探珍妃之事，怎知玉貴不準葛根提及珍妃，只肯透露他要結婚生子，并送他厚禮作為向他借種傳宗接代的代價，葛根很想推辭，但怕影響載灃交託的任務，故找伏苓商量。同一時間，如意向杜仲表明她要結婚，對象是玉貴，而他會找人借種生子。杜仲看見玉貴的聘禮后甚為愕然。

伏苓約杜仲見面，彼此看過玉貴送出的名貴禮物，心中有數。玉貴與如意喝過合巹酒后迷迷糊糊地暈倒，醒來時已被五花大綁。經杜仲和伏苓使計查問，玉貴承認返紫禁城的小屋遇見珍妃，被珍妃發現他私藏珍寶，玉貴還要強搶其珍珠鏈。

伏苓故意放走玉貴

二人糾纏間，珍妃失足跌落井里，玉貴害怕，連忙逃走。玉貴簽下押供詞，杜仲將他送交載灃處理，玉貴欲逃走卻被葛根扯開他的襪子，伏苓發現他的腳上有蝠鼠紋身，登時想起他是宮中的內應。與此同時，有一黑衣人踢開葛根，將玉貴和供詞一併帶走。三人追至郊外，伏苓故意扭傷腳，放走黑衣人和玉貴。

那神秘人正是七叔，他帶玉貴到破廟后說出暗號，玉貴亦能唸出暗語，他要求七叔以銀両交換臥底名冊，七叔答允并放走他。玉貴向慈禧請罪，騙說他找不到珍妃，卻無意中拾到她的珍珠鏈私藏起來，慈禧免他死罪只罰他到醇親王府作僕役。杜仲將珍妃信件和珍珠交到光緒手上，杜仲開解光緒，要他替珍妃胎兒復仇。載漪帶著兒子逃難，卻被載灃截獲。

百合雙腳微感知覺

載灃將載漪押至慈禧面前審訊，光緒指載漪下毒害他，又害死珍妃胎兒，連累珍妃無辜慘死，更勾結拳匪，引致八國聯軍入京掠寶兼要全國百姓為他賠款，罪大滔天，決定革除他所有爵位并發配南疆。是夜，光緒在瀛臺設祭壇拜祭珍妃。?

杜仲為百合蒸腳，百合要為杜仲煮湯丸慰勞，卻不慎被熱水濺到，百合驚叫覺得大腿有少許痛楚……