亞特蘭大事件后，核心圈便對變種人們的抵觸更加強烈。以往談好的和平共存，無論在底層變種人、軍隊之間，還是高層會議中，也不復存在?，F在地獄火俱樂部的負責人瑞瓦，在之前的亞特蘭大事件發生后，在會議中與核心圈的成員們決裂。她堅持招募北極星洛娜、安迪等人，卻遭到高層們的拒絕。瑞瓦做出了一個破釜沉舟的決定，她把有份決議的成員們，都殺死在會議室中，開創一個屬于自己的時代。
轉眼間，六個月過去了，洛娜也臨盆在即。變種人基地的成員們不斷轉移自己的根據地，一邊躲避軍方的追捕，一邊尋找自己的其他同伴。
在一次營救行動中，馬可斯、約翰和里德等人里應外合，救了一批被追殺的青少年。一位被帶回基地的女孩克里斯蒂娜被凱特琳救治后，便一直想找回自己失散的妹妹賈絲敏，哪怕是變種人組織們安排轉移他們，她也堅持不跟著大部隊轉移，堅持留守在這個臨時根據地，等找到妹妹再說。
洛娜每次胎動，都會引起附近金屬物的反應。盡管她和安迪歸順了瑞瓦后，瑞瓦為她提供了很好的環境和措施，避免所有金屬物在附近，但卻依舊難以評估洛娜臨盆時，會產生任何巨大的反應。
里德在自己獨立的一個房間中，用科技儀器對大伙兒進行調度，偶爾會發現自己身體出現些什么問題。從小到大，他都以一個普通人的身份生活著，直到最近，他察覺到自己體內有著來自血脈的巨大能量。或許，里德不去面對，屬于斯特拉克家族的宿命。
凱特琳這段時間，都一直在機會，試圖能聯系安迪。她認為自己，失去了安迪，但勞拉卻看清了事實。他們不是失去了安迪，是安迪選擇了離開他們。在安迪跟著洛娜轉身離開大伙兒的時候，凱特琳就該看清事實了。勞拉做了一個夢，她在夢中和安迪相聚，但未享受到片刻姐弟聚舊的愉悅，安迪便拉著她的手，想要施展毀天滅地的能力。勞拉知道，安迪已經變了，她找到凱特琳，想勸她清醒一點。
馬可斯擔心著洛娜，和她肚子里孩子的安危，他和同伴們一直在進行能量監察，一方面希望找出洛娜的下落，另一方面希望追蹤瑞瓦等人的所在地。時機到了，洛娜開始出現臨盆反應，周圍的金屬物、電能都出現了巨大波動。
洛娜產生的反應，影響了方圓數公里的電力，還有金屬物。馬可斯知道，這是洛娜造成的，估算了時間，洛娜現在要生了。約翰他們立即施展能力，試圖通過追蹤電能找出源頭，從而找到洛娜。電力波及的面積太廣泛，要找起來十分費勁，洛娜這邊，似乎受到了心理壓力，差點要難產。
瑞瓦不能失去北極星這個武器，她讓三胞胎幫忙控制洛娜的心智，讓她看見孩子出生后的美好畫面。在三胞胎的幫助下，洛娜誕下了一名健康女嬰。電網陷入了癱瘓，馬可斯無法再追蹤洛娜的所在地了。孩子出生的瞬間，作為父親的他，就此錯過。
三年前，約翰被人發現了變種人身份后，便失去了海軍陸戰隊的軍人身份，只能靠著在黑市打拳為生。拳賽一場接一場，約翰在賽事的間隙歇息時，一位優雅的女士找上了他。這是一位律師，也是一位變種人，叫伊凡潔琳。自此之后，約翰便受到伊凡潔琳的幫助，加入了變種人地下組織。
瑞瓦侵占了一處軍事建筑，給洛娜用于生孩子。洛娜生產過后，福斯特三姐妹給了負責人一筆錢，當作掩口費。但瑞瓦并不是這個意思，一向心狠手辣的她，要求福斯特三姐妹“處理干凈”。三姐妹中，在變種人地下組織待過一段時間的埃斯梅，漸漸地對瑞瓦的殘忍指令都留了手，她的不妥引起了另外兩名姐妹的懷疑。
約翰和馬可斯再次斷掉了核心圈的線索，經過一番查探，他們發現核心圈正在進行很多筆大額資金的轉移。為了接近核心圈，約翰想起了一位可靠的舊友——伊凡潔琳。
伊凡潔琳對于約翰來說，不僅有知遇之恩，還有復雜的情感。在約翰深受藥物困擾時，是她幫助約翰度過難關。他帶著馬可斯等人拜訪了伊凡潔琳，讓她感到既驚又怕。今時不同往日，如今變種人的地位比以往更難立足了，伊凡潔琳好不容易沒被軍隊的人盯上，面對約翰的求助，她顯得有點猶豫。
安迪最近做夢，在夢里能遇見勞拉，并看見自己主動拉著勞拉的手，希望她加入自己。但勞拉的樣子，好像十分懼怕自己，甚至為了掙脫自己的手，不惜跳樓。安迪從夢中醒來，心思絮亂。第二天訓練時，他的狀態十分不佳，這讓瑞瓦十分在意。
安迪隨意編了個理由搪塞過去，但瑞瓦豈是等閑之輩，她安排了一名會隱身的部下“隱藏”跟蹤安迪，看他葫蘆里賣什么藥。果然，安迪想念勞拉和家人了，他打電話到凱特琳的診所，想跟勞拉聊聊，但接電話的是父親里德。安迪在電話另一頭不敢作聲，最后毅然把電話掛掉后，毀掉了手機。但此舉動被“隱藏”看了在眼里，安迪的舉動立即被上報至瑞瓦那里。瑞瓦再次看見安迪訓練失利，認為他心里對自己的忠誠度不夠純粹，立即對他動起了殺心。
瑞瓦以一臉知心姐姐的姿態，來到安迪房間，想跟他聊聊，看他是否對自己坦白。安迪知道自己最近的表現讓瑞瓦十分不滿意，但他萬萬沒想到，自己只是想家了，會引來瑞瓦的殺心。在瑞瓦轉身，準備對安迪施展異能時，安迪不知怎地，想袒露自己想念家人的事，于是便把他打電話給勞拉的舉動，告訴了瑞瓦。瑞瓦聽后，念在安迪還是肯對自己坦白，于是收了手，恢復了知心姐姐的模樣。
伊凡潔琳自己不便出手幫助約翰，但她向約翰提供一個名字——爾格。這是一個住在華府地下隧道的獨立變種人，他手上有很多隱秘的情報，希望能幫到約翰。
馬可斯回想起自己父親臨終前的事，讓他覺得既抱憾又悲哀。他的父親患了癌癥，臨終前，都不愿接受馬可斯的資助，因為他不愿用馬可斯幫黑幫販毒賺回來的臟錢。但馬可斯卻為自己的生涯感到自豪，因為他今時今日，都是因為父親對他的拋棄所做成的。他的父親嘴里把上帝、仁愛放在嘴邊，但心底里卻嫌棄著自己的變種人兒子。
洛娜的孩子“晨曦”患了黃疸，這讓瑞瓦等人十分焦急。黃疸在新生兒中很普遍，也很容易治療，但洛娜的孩子卻不同，因為她是變種人，必須以非常的手法去治療，這或許得借助孩子的父親——馬可斯的能力。在醫生的建議下，瑞瓦積極配合洛娜，派福斯特三姐妹去聯系馬可斯，讓他過來核心圈的基地一趟。
如此同時，約翰在伊凡潔琳的指引下，和克拉麗絲來到下水道，希望聯系“爾格”?？死惤z一直對此事存有疑惑，她想不通為什么約翰會對伊凡潔琳的線索毫不懷疑，在下水道中轉悠了一陣子，克拉麗絲便顯得有點不耐煩，勸約翰離開。但約翰卻十分投入，他還察覺到，下水道中有人用異能打了一些墻，故意讓他們繞圈。爾格就在這下水道中的事實八九不離十了，接下來就看怎么能打破這異能造成的迷宮，讓他們找到爾格。
克拉麗絲轉著轉著，實在拿約翰沒辦法，她只好施展自己的異能，打破空間的限制，連通了爾格可能會在的空間。果然，他們通向了正確的地方，但也被爾格的手下們團團圍住。兩人表明來意后，卻未能獲得爾格的認同。約翰不想作無謂的斗爭，只好先按照爾格的意思靜觀其變。克拉麗絲跟爾格提出了一些請求后，卻獲得了爾格的認可，被他帶走了。約翰感到既無奈又無力，原本要尋求爾格幫助的人是他，現在反倒他成了局外人。
克拉麗絲在爾格的帶領下，來到一個讓人嘆為觀止的地下世界。這里生活著不被社會接受，不被人類世界所接受的變種人。他們不相信什么和平共處的信條，如果有一天，這些紛爭可以停止，那必定是雙方之間必有一敗。克拉麗絲遭到爾格認可，是因為她那穿越空間的能力，爾格似乎有意拉克拉麗絲入伙，希望她能運用自己的能力，和自己的地下變種人弟兄們并肩作戰。
克拉麗絲回到約翰身邊，簡單地告訴約翰，說自己和爾格談攏了。剛才看見的地下世界，克拉麗絲卻閉口不談。
馬可斯被帶到了洛娜那兒，夫妻再見，竟是相見無言。洛娜克制著自己內心的沖動，讓馬可斯幫晨曦治好黃疸。馬可斯激動地想要抱住洛娜，卻無奈地被瑞瓦、福斯特三姐妹、甚至洛娜勸止了。福斯特三姐妹知道馬可斯想什么，她們試圖著一直控制馬可斯的思想，讓他不要亂來，沒想到馬可斯的意識和能力不是那么容易控制，他對洛娜的執念超乎瑞瓦她們的想象。在福斯特對他的意識侵入時，馬可斯突然想反觀一樣，得知了福斯特三姐妹的秘密。為何洛娜會如此死心塌地跟在瑞瓦身邊，答案昭然若見。福斯特三姐妹對洛娜的意識做了手腳，控制了她的心。