因費莉希蒂的坦誠，導致綠箭團隊中的生力軍羅里有意退出。其他成員都有了各自的代號，雷內仍是“野狗”，伊芙琳以羅馬神話中的狩獵女神命名為“阿耳特彌斯”，柯蒂斯為“卓越先生”。但在抓捕丘奇手下塞吉奧的行動中，新手之間仍缺乏默契，負責遠程狙擊的野狗擅作主張提前開槍打草驚蛇，離目標較近的阿耳特彌斯慌亂之中弓箭未能命中，上前堵截的卓越根本就不是塞吉奧的對手。在遠處觀察指揮的綠箭不想再拖延時間，一箭命中目標的大腿，繳獲其從科爾德科技公司偷出的小匣子，結束亂成一團的抓捕行動。
對三名新手的表現，綠箭很不滿意。但他只是安排三人將罪犯和證據送到警局，隨后就匆匆趕回秘密基地，因為他有更重要的事情，營救約翰。對于如何將約翰從軍事監獄救出，奧利弗和萊拉已經有了詳細的方案，中間涉及到多項聯邦重罪。這讓費莉希蒂很不安，對這個行動的合法性也產生了質疑。因此解救行動只有奧利弗和萊拉參加，其他人休整。同時市政府的事務交給副市長昆汀和幕僚長西婭代理，奧利弗以療養為名休假一周。
這次行動奧利弗不再穿戴綠箭戰袍，而是黑色防彈戰術服及黑色面罩。他首先從帕爾默科技公司偷出反分子化合物。費莉希蒂曾在帕爾默公司工作，為了不牽扯到她，奧利弗只能出此下策。得到關鍵物品后，在萊拉的協助下，奧利弗躲在一堆干洗的床單里潛入監獄。可奧利弗找到約翰的監室時，發現并沒有人，約翰正在放風區活動。為了抓緊時間，奧利弗不得不鋌而走險，觸發監獄警報。
返回監室的約翰不想越獄，但如果執意不離開奧利弗就會被抓，兩難之下只能同意。奧利弗將反分子化合物噴在監室地面，很快地面就被分解出一個大洞，直通監獄下水道。從下水道回到地面，監獄里已是警報聲大作。持槍警衛發現奧利弗和約翰，紛紛舉槍靠近。奧利弗用綁縛帶將自己和約翰連在一起。這時一架大型C130運輸機從空中掠過，奧利弗射出的鏈鉤穿過敞開的后艙門，死死鉤住機艙里的鋼絲網。一般巨大的沖力，帶著奧利弗和約翰騰空而起，飛過了監獄的上空。
奧利弗將約翰和萊拉暫時安置在“蜂巢”。直到此時他才看到手機上費莉希蒂發來的緊急消息。原來塞吉奧偷盜科爾德公司的小匣子根本就是個幌子，匣子里并沒有高科技物品，而是強力炸彈。當小匣子存入警局的物證保管倉庫時，發生了劇烈的爆炸。倉庫里收繳的艾美科技高精武器，被早已守候多時的丘奇帶領手下輕而易舉搶走。之后丘奇有恃無恐，沖進警局試圖解救塞吉奧。危急時刻，原諒了費莉希蒂的羅里再次加入團隊。四名新人決定出動，阻止丘奇的犯罪行為。
經過激烈的戰斗，雖然地檢官蔡斯安全脫險，塞吉奧也仍在警方的控制之下，可警局人員傷亡慘重，卓越先生身受重傷，野狗也落入了丘奇之手。奧利弗必須處理這個爛攤子，他不能拋棄約翰，綠箭同樣不能丟下野狗。
野狗雷內被抓后，慘遭折磨。在被打得意識模糊之時，他稀里糊涂的叫出了奧利弗·奎恩的名字，讓丘奇知道了星城市長奧利弗就是綠箭。同時也正是因為野狗迷糊的狀態，讓丘奇放松了警惕。野狗依稀聽到丘奇在安排一個重要計劃。
綠箭沒有放棄尋找野狗，團隊成員在城內四處抓捕黑幫份子，可只得到了大致方位。在一人下落不明，一人受傷的情況下，約翰趕到了基地，愿助奧利弗一臂之力。既然暫時沒有線索，奧利弗決定先回市長辦公室，推進一項擴大廉價住房的方案。目前副市長昆汀在負責擴充“打擊罪案小組”的人手，西婭則在極力推動擴建廉價房的方案。但擴建區的庫倫斯議員反對這項方案，讓西婭頭痛不已。
奧利弗還沒想好如何對付固執的庫倫斯議員，基地就傳來消息，發現了丘奇和雷內。綠箭前去救人，讓他意外的是，丘奇似乎無心戀戰，沒作任何反抗就逃走了。這時傷痕累累的雷內說出了原因，因為丘奇知道了綠箭的另一個身份。殺市長比殺綠箭容易得多。
身份已經泄露，奧利弗只能派未受傷的破爛人和阿耳特彌斯保護西婭和昆汀，他在保安隊的護送下前往市政廳辦公，約翰則負責從雷內的嘴里盤問出丘奇的計劃。如果說丘奇打算在綠箭死后實行他的計劃，約翰心里想到了一個人能扭轉局勢。
在市政廳，奧利弗見到了庫倫斯議員和隨同議員到來的媒體記者蘇珊·威廉姆斯。蘇珊一直熱衷于抨擊奧利弗的市長工作，這次碰面也算是冤家路窄。在會談時，庫倫斯議員堅決反對廉價房方案。25年前星城有過同樣的計劃，可資金注入后并沒有流向建造廉價房，而是蓋起了摩天大廈，奎恩集團的辦公樓就是其中之一。這一手是奧利弗始料未及的，一時啞口無言。
不過奧利弗有自己的辦法，他先聯系了蘇珊。畢竟一直應付蘇珊的負面報道，會分散奧利弗的很多精力，化敵為友更有利于雙方。他請蘇珊暫停一個月，在這段時間里，他會傾盡所有能力向蘇珊證明。奧利弗真誠的態度，引起了蘇珊的興趣，同意了他的要求。
對于庫倫斯議員，奧利弗和西婭找到了他虛偽的證據。庫倫斯的家族企業有意在他的選區進行商業改造，所以庫倫斯才反對廉價房的擴建方案。他并非為了維護窮人的利益而反對，而是對利益分配不滿。如果奧利弗把證據材料送給蘇珊，庫倫斯的政治生涯就會結束。
成功推進了廉價房方案后，奧利弗和西婭長舒一口氣。天色已晚，兩人在保安隊的護送下走出市政廳。突然一名蒙面男子沖出來，對著奧利弗連開數槍，隨后在夜色掩護下逃走。西婭眼睜睜看著奧利弗中槍倒在市政廳前的臺階上，閉上了雙眼。凌晨，昆汀和西婭在醫院召開新聞發布會，宣布市長奧利弗不治身亡。
奧利弗和團隊成員站在基地的屏幕前看著昆汀宣讀市長的訃告。另一個身上滿是槍孔的奧利弗走進來，一把扯掉臉上的假皮膚，露出真正的面容?？死锼雇懈ァゅX斯，精于易容又有不死之身，是約翰推薦來的最佳替身?？死锼雇懈ゲ⒉皇堑谝淮尉葕W利弗的命，當年在兄弟會，他受阿納托利雇傭，暗中保護過奧利弗。
雷內也在約翰的指導下，想起彌留之際丘奇曾對手下說過的話。丘奇將于今天凌晨，在私人機場接某個犯罪集團頭目。在丘奇以為綠箭已經死亡的情況下，必定會準時出現。于是奧利弗披上戰袍帶領成員前往機場，約翰也再度成為斯巴達一同前往。斯巴達精準的槍法讓丘奇和他的手下亂作一團，綠箭和其他成員趁機逐一擊破，將丘奇活捉。
奧利弗市長以詐死清除了丘奇犯罪集團，并讓廉價房方案獲得市議會通過，這一連串的舉動得到媒體的贊賞。但威脅并沒有過去，蘇珊沒有像她承諾的那樣給奧利弗一個月時間。她通過自己的渠道得知了假冒市長的替身身份，進而查到奧利弗五年前在兄弟會的一張照片。而押送丘奇的車隊受到襲擊，襲擊者正是普羅米修斯。丘奇以為用綠箭的真實身份能換自己活命?？蛇@個秘密，普羅米修斯不會允許除自己以外的其他人知道。
普羅米修斯殺死丘奇后，仍故布疑陣讓綠箭東奔西跑尋找線索。綠箭和斯巴達調查了近一個星期都沒有發現普羅米修斯的蹤跡，只收到一句《巴比倫五號》中的臺詞“一切自此開始”。
對于普羅米修斯的動機西婭不感興趣，作為市長的幕僚她現在只想著如何發展城市經濟，目前最好的辦法就是舉辦音樂節，為星城做公關宣傳。曾經營夜店的西婭對舉辦這種活動并不陌生，副市長昆汀也能找到舉辦場地，似乎所有事情都很順利。可就在音樂節前，出亂子了。一名家庭主婦和一名出租車司機被殺，兇器是星形飛鏢，與殺死丘奇的兇器完全一樣。這兩起特殊的兇殺案不僅驚動了地檢官蔡斯，也引起了綠箭的注意。費莉希蒂嘗試通過各種對比都無法確認兩起案件的關聯，在約翰的提醒下，她偷偷從警探男友比利·馬隆的桌上偷來了物證，星形飛鏢。
記者蘇珊不知從什么渠道得到了消息，在節目上報告了這起系列兇殺案，讓星城民眾人心惶惶。在這種惶恐氛圍下，常因誤會發生騷亂。有人認為自己看到了普羅米修斯就胡亂開槍，更讓恐怖氣氛漫延。綠箭不得不帶領小隊成員平息騷亂，盡量安撫民眾。
城市里陷入混亂時，昆汀卻一直未出現。想到副市長時常上班時間遲到，西婭懷疑昆汀并沒有戒酒，從昆汀辦公桌里找到的酒瓶也證實了她的猜測。當西婭趕到昆汀家中，看到的是滿地的垃圾，擺滿桌面的空酒瓶和昆汀醉眼朦朧的眼神。即使如此，西婭仍未放棄昆汀，鼓勵他參加互助會，盡早擺脫對酒精的依賴。
在柯蒂斯的協助下，費莉希蒂終于找到了兩名死者的聯系。死者生活中并沒有交集，普羅米修斯選擇他們的原因，是因為他們的名字。兩名死者的姓名字母重新排列后，會生成幾個新的名字。而這幾個名字奧利弗非常熟悉，都在父親筆記的名單之中。
有了這條線索，費莉希蒂逆向排列，以奧利弗提供的名單倒推，找到了六名可能成為普羅米修斯目標的人。因此綠箭安排各成員分別跟蹤保護一個目標，發現普羅米修斯出現就馬上通知所有人匯合。
阿耳特彌斯伊芙琳的保護目標是名地鐵司機，她在飛馳的地鐵上首先發現了普羅米修斯。普羅米修斯顯然低估了年青對手的能力，胳膊上被阿耳特彌斯割出一道傷口。這反而激發了普羅米修斯的怒火，阿耳特彌斯被打得倒在地上無力起身。在普羅米修斯走向驚恐的地鐵司機時，綠箭聞訊趕到，一箭射中普羅米修斯的后背。箭頭嵌在后背的防護甲上，普羅米修斯一把扯下來向車頂擲去。車頂應聲炸出個大洞，普羅米修斯一躍而出消失在地鐵隧道中。
普羅米修斯似乎并不想作戰，其實是已在駕駛臺安放了定時炸彈。當綠箭察覺時，只剩十余秒的時間。此時地鐵已經沖出隧道，馳上了高架軌道。綠箭用掛鉤鉤住阿耳特彌斯和地鐵司機，然后對著車頂的大洞射出一箭。箭頭在空中展開形成降落傘，綠箭拉著兩人騰空而起飛出車廂，一個巨大的火球在身后升起。
目標暫時安全了，為以防萬一，地檢官會為他們安排證人保護計劃。費莉希蒂對飛鏢的檢測也有了進展，她發現這些飛鏢的材料是綠箭在過去四年里射出并保留在物證室的箭支。也就是說普羅米修斯能進入警方物證室，溶化這些箭支后做成自己的武器。
普羅米修斯到底是如何拿到箭支，奧利弗還無暇調查。今晚，西婭舉辦的音樂節開幕。這么重大的活動，提供場地支持的副市長昆汀卻遲遲未到。昆汀此時昏昏沉沉的從沙發上醒來，手機鈴聲不停，屏幕上顯示著西婭的名字。他感覺到胳膊一陣疼痛，一道傷口仍血跡未干，凌亂的桌上還有一枚星形飛鏢。