肖若云悄悄告訴東方靖琪，東白山來人約好次日十二點在茶樓和她見面。次日東白山來人見面時肖若云在樓下望風，她讓東方靖琪去包間見接頭人。東方靖琪推開包間的門，接頭人回過頭，東方靖琪震驚地呆立原地，來人竟然是杜明海。
東方靖琪憤怒地扇了杜明海一耳光，她一邊流著淚一邊怒斥杜明海這些年去了哪里，為什么不聯系自己。她接二連三的質問讓杜明海心碎，他一把把東方靖琪抱進懷里，兩人喜極而泣。
杜明海告訴東方靖琪，他受傷后被游擊隊救起，然后他和游擊隊一起去了蘇北。現在他要就任東白山的大隊長，這一次他就是專門來找東方靖琪為東白山弄紅傷藥。東方靖琪答應了。
周山口為了獲得東方靖琪的信任，他主動承擔這次送藥到東白山的任務。在周山口百般懇求下，東方靖琪終于答應由他送藥去東白山。周山口馬上把東方靖琪的計劃告訴秋田，秋田同意讓他完成把藥送到東白山的任務，只有這樣他才會獲得東方靖琪的完全信任。
周山口和阿祥一起送藥和糧食出城，東方靖琪原本準備跟出去一起，誰知在城門口杜明江卻堅持攔住她，因為秋田暗中交代過杜明江絕對不能讓東方靖琪出城。東方靖琪一時走不了便把杜府金鑰匙交給周山口作為信物，她說杜明溪見到鑰匙就會相信他。
周山口在送藥途中想到秋田的囑咐，秋田讓他殺了阿祥，因為阿祥根本就是秋田安排的假新四軍。秋田不放心任何一個人中國人，他擔心阿祥把周山口身份泄露，他命令周山口殺了阿祥滅口。周山口乘阿祥不備用匕首殺了他。
周山口順利把藥和糧食送到了東白山，杜明溪十分不解以東方靖琪的謹慎為什么會輕易相信周山口。她還是謹慎地將周山口蒙著眼接上山和送下山。
周山口從東白山回來后東方靖琪非常感激和信任他，周山口還帶信給東方靖琪下一次新四軍送藥地點在花明泉村。東方靖琪告訴周山口自己決定次日就把紅傷藥的配方告訴他。周山口心中暗喜。
周山口向秋田匯報后，秋田讓他不要親自去花明泉村，以免雙方動手起來誤傷了他。送藥那天周山口謊稱拉肚子不能親自去，東方靖琪便委托肖若云和長壽帶人送藥。此時杜明江按照秋田指示埋伏在花明泉村。
杜明溪安排三金先探查一番，三金看到肖若云過來把情況匯報給杜明溪，杜明溪覺得情況有異決定暫時按兵不動。肖若云和長壽久等杜明溪不來接頭便進村找她，見到杜明溪后長壽無意間提到前一次送藥過來的阿祥。杜明溪很吃驚，因為他們根本不認識叫阿祥的人。再仔細分析后，杜明溪斷定周山口是個J細，眾人大驚。
這時長壽提到屋外送藥一起過來的還有四個弟兄，杜明溪讓他把那幾個人叫過來。然而就在長壽叫那四人時，何家寶突然開槍打中那四個人，一時間雙方交起火來。杜明溪見杜明江火力強勁，她趕緊發信號彈到空中。這時東白山大隊長杜明海正趕來到任，看到信號彈聽到槍聲他們急忙進入戰備狀態。
肖若云拔槍反擊杜明江，杜明江開槍擊中了肖若云。眾人大驚，長壽撲過去想救肖若云，何家寶突然沖出來拿槍脅迫了長壽。眾人投鼠忌器不敢再輕舉妄動。
何家寶挾持長壽，杜明海和杜明溪等人投鼠忌器不敢再開槍，何家寶押著長壽撤退。他們行至半路發現新四軍并沒有人追上來，這才松了口氣。長壽憤怒地大罵杜明江投靠日本人做漢J走狗，還罵他和周山口勾結。杜明江惱怒地拔槍打死了長壽，長壽倒地前順手牽羊拿走了杜明江身上的玉佩緊緊地攥在手里。
此時杜明海扶起血流如注奄奄一息的肖若云，肖若云再次看到他欣喜若狂，她沒有想到還能再見杜明海，沒想到他竟然還在人世。肖若云傾訴著對杜明海的愛，希望下輩子他能像愛東方靖琪一樣愛自己。最后她幸福地閉上眼睛。
杜明海埋葬了肖若云，他心里非常難過。在新四軍辦公室里，馬致遠面對杜明海非常尷尬，兩人都沒有想到他們會在此情此景下重逢。杜明海大義地稱，自己一直想不通當年他怎么會朝自己開槍，畢竟他們是從小玩到大的發小。不過現在他們為了抗日大計個人恩怨就一筆勾銷。杜明海大度地主動向馬致遠伸手示好，馬致遠握了上去。
杜明江把長壽的尸體送給秋田，他邀功稱自己殺了長壽保住了周山口的身份不被泄露。秋田似乎并不領情，他提醒杜明江，他的弟弟杜明海現在是新四軍大隊長。杜明江趕緊撇清自己和杜明海勢不兩立的關系。
東方靖琪見長壽和肖若云一直沒有回來非常擔心，周山口主動提出自己去尋找。很快長壽的遺體被周山口送到東方靖琪面前。周山口稱他在花明泉村村口發現了長壽的尸體，至于肖若云，他聽說也中了槍現在下落不明。長壽的死讓東方靖琪心如刀割，而肖若云生死未卜更讓她憂心忡忡。
這天東方靖琪在集上突然看到一個阿祥，阿祥看到她拔腿就逃。東方靖琪追上他，阿祥急忙解釋自己被周山口收買假裝東白山的新四軍，后來周山口又在送藥途中對自己下了毒手，當時他裝死才撿回一條命。東方靖琪震驚不已。
東方靖琪回到孤兒院時，孤兒們把從長壽手里發現的玉佩交給她。東方靖琪認出這是杜明江的，她頓時明白是杜明江殺了長壽。她憤怒地去找杜明江狠狠地扇了他一耳光，她警告杜明江如果肖若云有危險自己一定會殺了他。東方靖琪離開后，杜明江呆呆地愣在原地。
杜明海從東白山下來見到東方靖琪，他心情沉痛地告訴她肖若云的死訊。他勸東方靖琪跟自己一起離開，到新四軍那邊建藥廠。
杜明海問到東方靖琪跟自己離開考慮的如何，東方靖琪顧及藥廠、孤兒院和杜家還有那么多人她不能說走就走，她還要再考慮考慮。
倉橋向秋田匯報運到前線的紅傷藥沒有一點療效，秋田勃然大怒。周山口明明掌握了紅傷藥所有工序，秋田頓時明白東方靖琪從中做了手腳。他到遠山藥廠質問東方靖琪，東方靖琪義正辭嚴地表示自己不可能為日本人制藥。秋田突然抬手打死一個工人，他說再生產不出有效的藥品他就每天打死一個工人。秋田傲慢地離開，眾工人憤怒地目眥盡裂。東方靖琪終于做了當機立斷的決定。
周山口繼續在東方靖琪面前做出深情蜜意的樣子，東方靖琪故意長吁短嘆地表示自己心力交瘁，她希望周山口帶自己離開。接著她又說自己現在只有他一個信任的人，她希望周山口去幫自己去取神農藥典，他們拿到書就馬上離開暨陽。她告訴周山口藥典藏在晉安九峰山懸空寺里。周山口按捺不住心中的狂喜忙不迭地答應幫忙取書。
東方靖琪去找了阿祥，她為阿祥治過傷，阿祥對她感恩戴德。東方靖琪希望他幫忙把周山口獨自去找藥典的事透漏給杜明江。很快，杜明江便把此事報告給秋田。秋田惱怒地半路攔截住周山口，他命令杜明江和周山口一起去找書。走之前杜明江讓何家寶留下來密切監視東方靖琪。
何家寶在跟蹤東方靖琪時發現她把藥廠現銀全部提走，他攔截住東方靖琪質問她是不是要逃走。歪脖及時趕到打暈何家寶。東方靖琪離廠前默默地看著凝聚著杜遠山和自己心血的藥廠心中百感交集，因為她已經計劃好離開前炸了廠房不讓它落到日本人手里。
東方靖琪回到杜府，然后從杜家祠堂里取出藏在這里的神農藥典。她跪在杜遠山靈位前焚燒了藥典，她說自己已經把書籍里的內容全部記在腦海里，書籍不能落入日本人手里。東方靖琪又勸大太太離開，大太太卻固執地要和杜府共存亡。東方靖琪只好勸她保重，然后她帶走了孤兒院所有孩子。
周山口從晉安回來心有不甘，他不知道為什么沒有在那里找到神農藥典。他要去找東方靖琪詢問，杜明江不無鄙夷地告訴他，東方靖琪早就對他生疑，這次取書完全是為了支開他。周山口不信，直到找不到東方靖琪又看到她留給自己的信后，他才知道東方靖琪早在刑場他詢問自己藥典下落時就開始懷疑他。
此時在杜家念經的大太太早就心灰意冷，所以在蠟燭倒塌點燃佛堂帷幔時她聽之任之，直到杜府燃起熊熊大火，大太太臉上露出解脫后的笑葬身火海。緊接著馬致遠點燃炸藥，遠山藥廠在爆炸聲中被夷為平地。秋田氣急敗壞。
秋田集合所有日軍對東白山發動進攻。杜明海讓杜明溪帶著東方靖琪和孤兒院的孩子趕緊撤離，很快秋田帶著日軍與杜明海的部隊交上火。東方靖琪讓杜明溪帶著孤兒院孩子離開，她堅持要回去找杜明海。
半路上周山口突然攔住東方靖琪，他憤怒地指責東方靖琪欺騙自己并讓她交出神農藥典。他冷笑著告訴東方靖琪自己是個日本人，只有日本人才配擁有神農藥典這樣的書籍。就在他拿槍脅迫東方靖琪時，東方靖琪卻乘其不備突然掏槍打死了他。
此時杜明海帶著新四軍與秋田展開激烈槍戰，槍戰中杜明江和何家寶雙雙被打死結束了他們罪惡恥辱的一生。然而在最后的肉搏戰時，杜明海打死了秋田卻被兩個背后偷襲的日軍用刺刀刺透胸膛。
戰爭結束后，東方靖琪被任命接管新四軍被服廠、修械所和藥廠。東方靖琪臉上露出堅強的表情，她要繼續杜明海沒有完成的抗日大計。東方靖琪帶著長順來到杜明海墓前，她在心中默默地告訴杜明海，他沒有白白犧牲，所有孤兒已經安全轉移，自己一定會把長順撫養長大，因為他們就是未來的希望和力量……
（全劇終）