以幕末的長崎為舞臺,有坂本龍馬擔任的偵探而活躍的推理劇,正在負責寫腳本的編劇家耕作先生突然消失蹤影,只寫了一半的劇本則委托小五郎先
生幫忙推理出劇中的真正犯人,調查了耕作房間的柯南等人發現了許多古董美術品竊盜團的簡報,這一切似乎都有著隱情。失蹤中的耕作先生利用郵
件將后續的劇本傳送過來,在劇本中出現了奇怪的臺詞。
被襲擊的迫田暈倒前指向了小蘭,擁有空手道段數的小蘭被懷疑,尋找到目擊證人的柯南還從飾演過蝴蝶夫人的兩位演員身上找到了小蘭飾演角色的
原型,而劇本內第二起殺人事件的死亡訊息也不知道蘊含著什么意義。案件變得更加撲朔迷離,擁有犯罪嫌疑的人越來越多,而在案件還沒解決的情
況下又有人遭到了襲擊。
在砂田善三叔叔的邀請下園子、小蘭和柯南一起來到溫室觀看開花的金琥,在參觀的過程中愛發脾氣的善三叔叔和自己的兩個兒子因為遺囑的事情起
了爭執。吃過八代小姐做的晚飯后柯南等人聽見了溫室的警報聲,趕過去的他們看到的是握著遺囑驚慌失措的康之,而砂田善三已經死在了溫室里。