一九三一年三月，日本駐哈爾濱生化武器研究小組成員龜井壽不慎感染了鼠疫，由于害怕遭到殺害，他悄悄地逃了出來。
日本黑龍會(huì)駐哈分會(huì)會(huì)長內(nèi)田武巖，為防止日本秘密研究生化武器的事情敗露，命令特別行動(dòng)組組長山口良雄率人馬上追殺龜井，并在哈爾濱市立醫(yī)院內(nèi)將龜井截住，就在山口準(zhǔn)備將龜井殺死時(shí)，被守備旅上尉軍醫(yī)冷風(fēng)及其弟冷動(dòng)制止，山口從手下口中得知，冷風(fēng)與冷動(dòng)為哈爾濱商會(huì)會(huì)長冷春秋的兒子，于是不敢正面發(fā)沖突，只得藏在醫(yī)院內(nèi)，暗中尋找下手時(shí)機(jī)。
冷風(fēng)經(jīng)過對龜井的檢查發(fā)現(xiàn)其已染上鼠疫，于是迅速將情匯報(bào)給了守備旅旅長張大炮，并要求張及時(shí)向少帥張學(xué)良匯報(bào)，以及進(jìn)行全城檢查。
張大炮與市長錢秉文由于害怕貪污防疫?？畹氖虑閿÷?，拒絕了冷風(fēng)的請求，無奈的冷風(fēng)只得向好友，時(shí)任守備旅警備隊(duì)隊(duì)長的七條尋求幫助，七條決定協(xié)助冷風(fēng)將事情匯報(bào)給張學(xué)良。
山口趁冷風(fēng)離開之時(shí)，將龜井及接觸過龜井的醫(yī)生殺害，就在他準(zhǔn)備將龜井的尸體帶回時(shí)，冷風(fēng)返回了醫(yī)院，山口只得無奈的離開。
冷風(fēng)發(fā)現(xiàn)龜井及醫(yī)生遇害，感到事情的嚴(yán)重，于是一方面將龜井的尸體轉(zhuǎn)移，準(zhǔn)備進(jìn)行解剖，另一方面請求七條派兵來醫(yī)院戒備。內(nèi)田見山口沒有帶回龜井的尸體很是生氣，命令山口馬上去醫(yī)院搶回尸體。就在山口來到醫(yī)院尋找尸體時(shí)，七條也帶兵趕到，雙方發(fā)生激烈的交火。
七條將山口從醫(yī)院中擊退，將冷風(fēng)從被困的手術(shù)室中救了出來，但冷風(fēng)的助手姚玲不幸被流彈擊中，所幸被門板所擋，沒有生命危險(xiǎn)。
守備旅在醫(yī)院發(fā)生槍戰(zhàn)的消息很快傳遍哈爾濱的大街小巷，張大炮率人馬上趕到醫(yī)院，同時(shí)冷春秋擔(dān)心冷風(fēng)出現(xiàn)意外，帶人也來到了醫(yī)院。
冷風(fēng)的媳婦喜妞在院看見冷風(fēng)正在為姚玲療傷，醋意大生，與冷風(fēng)發(fā)生爭吵。返回黑龍會(huì)的山口被內(nèi)田大加訓(xùn)斥，因?yàn)榕c守備旅的正面沖突，已導(dǎo)致冷家對日本人施行了經(jīng)濟(jì)制裁，使得日本在哈爾濱的僑民日常生活陷入困境。
內(nèi)田來到冷家，想與冷春秋講和，但被拒絕。冷風(fēng)與七條分析后認(rèn)為龜井有可能是從下水道中逃出，所以派兵對全市的馬葫蘆蓋進(jìn)行檢查，希望能找到龜井逃出時(shí)留下的線索，以便能夠追查到鼠疫的來源。
與此同時(shí)蘇聯(lián)也發(fā)現(xiàn)哈爾濱出現(xiàn)鼠疫的情況，為了了解是否為日本的生化武器專家坂稻一所為，他們派出了一個(gè)有著東方面孔的特工來到了哈爾濱。
冷風(fēng)獨(dú)自一人來到市立醫(yī)院附近的街道搜查，遭到山口的偷襲，被前來找冷風(fēng)的冷動(dòng)等人趕跑，原來冷動(dòng)在哈爾濱有一個(gè)建筑公司，剛剛從蘇聯(lián)聘請了一位名叫科恩的建筑師，由于冷動(dòng)不懂俄語，所以前來找冷風(fēng)陪同到火車站接站。
火車上日本特務(wù)稚子將科恩殺害，并故意與蘇聯(lián)派來的特工何三關(guān)坐到了一起。
冷風(fēng)與冷動(dòng)來到車站，與冒名科恩米拉的稚子和何三關(guān)一番寒喧后，將冒充科恩的稚子接回馬迭爾旅館，山口也悄悄的尾隨趕到。
稚子為防止坂本稻一實(shí)驗(yàn)室位置暴露，命令山口把通往實(shí)驗(yàn)室的線索掩蓋掉。
何三關(guān)來到蘇聯(lián)駐哈的情報(bào)機(jī)關(guān)，讓情報(bào)員瓦西里幫助調(diào)查稚子的真實(shí)身份，并決定從冷家開始調(diào)查鼠疫的事情。由于冷家的經(jīng)濟(jì)封鎖，使得坂本的實(shí)驗(yàn)器材運(yùn)不進(jìn)來，這讓內(nèi)田很是著急，決定再次前往冷家，與冷春秋講和。
冷風(fēng)來到守備旅，向張大炮索要交火當(dāng)天交給七條的皮箱，因?yàn)槔锩嫜b有龜井尸體切片，對調(diào)查鼠疫有著至關(guān)重要的意義，但是張大炮卻謊稱皮箱已被自己銷毀，冷風(fēng)只得無奈的離開。
黑龍會(huì)內(nèi)張大炮手下林副官將皮箱交給了內(nèi)田，并把從內(nèi)田那里得到的酬金交到了張大炮手上。
冷風(fēng)又氣又恨的回到醫(yī)療所，對七條大發(fā)雷霆，斥責(zé)他不應(yīng)該把這么重要的東西交給張大炮，七條聽后不知所措，冷風(fēng)突然想起自己在醫(yī)院附近的下水道口被山口偷襲，于是七條決定先帶人過去調(diào)查，讓冷風(fēng)先回家，安頓好后再去。
內(nèi)田來到冷家，對冷春秋軟硬兼施，但絲毫不起作用，反被冷春秋罵得無地自容，趕了出來。
七條來到下水道口處，遇到了正在銷毀證據(jù)的日本特務(wù)，七條用計(jì)將對方打死，并立刻派兵去冷家找冷風(fēng)，自己則率兵進(jìn)入下水道調(diào)查。何三關(guān)回到人以寓，從懷中掏出冷家所有人的照片，似乎他與冷家之間有著一種難以言表聯(lián)系。
剛剛到家的冷風(fēng)被趕來的士兵叫走，七條在下水道中發(fā)現(xiàn)了一處被人剛用水泥封住的管道口，于是命令士兵把水泥砸下來，不料聲音太大，驚動(dòng)上面的日本人，坂本稻一讓山口找來了煤氣罐，向下水道中施放，士兵由于煤氣中毒都沒了力氣，七條不明原因，以為手下偷懶，于是讓他們回井口把守，自己一個(gè)繼續(xù)挖墻。
何三關(guān)喬裝潛入冷家，將一幅寫有“關(guān)帝顯圣，血債血還”八個(gè)字的關(guān)公畫像，掛到了大廳里，隨后趕到的冷府管家李忠信看到后，嚇的癱倒在地。