被啟示病毒肆虐的東京，GHQ?對(duì)其下達(dá)了都市隔離命令。被留在學(xué)校的集等人，在無法得知外界情報(bào)的狀況下生活著。為了讓眾人打起精神，於是颯太提議舉辦校慶活動(dòng)，但同樣在此避難的綾瀨，卻因?yàn)闊o法救回涯而懊悔不已。在校慶當(dāng)天，一群暴徒襲擊了校園，聽著綾瀨哭訴心聲的集取出了她的空洞……

在封鎖的校園中生活，學(xué)生們的不安與壓力即將到達(dá)臨界點(diǎn)。對(duì)學(xué)生會(huì)長供奉院亞里沙感到諸多不滿的學(xué)生們，受到噓界策動(dòng)的謠言驅(qū)使，將綾瀨與鶇抓了起來。失去指揮權(quán)的亞里沙，面對(duì)這個(gè)情況已經(jīng)無能為力。此時(shí)，集向眾人說出自己是葬儀社成員一事，并提出了某個(gè)提案。在混亂的情況下，眾人推選出的新任學(xué)生會(huì)長是……

集當(dāng)上學(xué)生會(huì)長，肩負(fù)起領(lǐng)導(dǎo)職位後，學(xué)生們也恢復(fù)了平靜。然而，「紅色警戒線」不斷前進(jìn)的威脅下，問題堆積如山。為了跨越這個(gè)難關(guān)，谷尋提出了「空洞分級(jí)制」。集認(rèn)為這制度會(huì)造成學(xué)生之間的不平等，而拒絕執(zhí)行，但抑制啟示病毒的疫苗開始不足，身為領(lǐng)袖的他被迫要做出決定。