黃大年寬慰要去國外工作的衛宏遠，讓他不用耷拉著腦袋，能到更高的平臺去開眼界那是好事，但將來為誰而奉獻一定要想清楚，出去了一定要記得回來。

黃大年為了參加本科班的畢業典禮而未能去參加女兒的大學畢業典禮，但他及時給彤彤發了短信祝福她的成長，并告訴她作為父親他的心永遠和她在一起。

劉躍叮囑黃大年務必參加中央組織的“千人專家”療養，黃大年卻接到國外電話聽說k計劃有了重大突破，內心不禁對科研工作焦急起來。黃大年本打算放棄療養，劉躍知道他的憂心所在，于是透露有個國際裝備年會也在療養地召開，這才勾起他的興趣。

打著療養的名義，黃大年邀約海歸、專家就地開起了閉門會議，學術共享的積極態度讓在場專家無不欽佩。黃大年趁機說服海外專家歸國圓夢，拉住海洋領域專家閆偉對他說雖然回國研究工作會遇到這樣那樣的困難，但在自己國家的土地上搞研究心里踏實，試圖打消閆偉回國的顧慮。

療養期間獲益頗豐的黃大年清晰了科研提速的新思路，又是馬不停蹄地搭深夜的飛機回到學校，他告訴學生們這次和國家領導人見面后能夠強烈感覺到中因對實現中國夢的迫切和對解決能源短缺這種急切心情，他決定對S09項目提前結題，程果擔心一味追求進度會讓人感覺冒進。黃大年提出實行紅藍軍路線的辦法，紅軍路線就是立主自身實現突破，藍軍路線就是在國外既有高端平臺上的二次開發，推動整體進度，實現快速突破。

為了更廣泛地進行學科交叉服務科研，他借聯誼會之機向校內專家提出紅藍軍對標方案，在吉林大學校內逐漸成立“科研特區”。

S09項目的科研經費批下來了，黃大年的辦公室也被踩平了門檻，桌上的電話就沒停過，連多年不見的老朋友宋坦也專程上門要求合作，黃大年鐵面無私一律回絕，雖然將好友拒之門外令他心中隱隱作痛，然而在國家利益面前這些都變得微乎其微，他就是要把事辦好，也要辦得干干凈凈。

元宵佳節黃大年又遠赴北京向領導匯報工作，國事家事難兩全，他只得在登機前向妻子發條短信表示歉疚。

北京之行黃大年順利拿到申請的科研經費，還破例被追加了一個億，好消息傳來劉躍和學生們都興奮不已。而回到吉林大學的黃大年提出要搞全國學科大交叉，要在全國范圍內尋找專業學術突出的團隊共同合作，為了科研工作他不怕被人說肥水流了外人田。

劉躍撞見黃大年偷偷吃藥緩解身體病痛，擔憂焦急要將黃大年送到醫院檢查。黃大年稱科研正在關鍵階段，請求劉躍別將此事告訴雪梅。

黃大年夫婦前往英國參加彤彤的婚禮，但令令黃夫人和彤彤倍感無奈的是，黃大年一下飛機就被艾文接走去參加了研討會，彤彤不禁抱怨爸爸這是來參加自己的婚禮的嗎？

黃大年在深探項目驗收前夕又是十多天沒日沒夜地趕工，腹部的疼痛越來越頻發，劉躍心急如焚，他強迫黃大年停下工作去休息，并發誓再不幫他對外保密，劉躍深知黃大年一旦倒下，自己將成為歷史的罪人。

最終項目順利通過評審驗收，評審組宣布項目成果處于國際領先水平，這意味著黃大年的團隊已經實現了他當初回國時的誓言，也意味著中國重型深探裝備技術正式宣告突破國外封鎖，完成跨代設計，進入世界第一梯隊。