肖肖默發現在飛往黎明機場的途中會有雷雨云形成，根據他們的飛行計劃路線，吳迪說應該可以避開雷雨云。夏宇主動提出這程他來飛，但肖默不同意。肖默本意是為了飛行安全，但看在夏宇眼里，就是肖默想自己顯擺。兩人說著說著又吵了起來，在吳迪的勸說下兩人才作罷。肖默退一步，答應這一程由夏宇來飛，但他有一個條件，一旦遇到任何緊急情況，都要由他來控制，夏宇也答應了。他們所駕駛的B10YT，航線上有積雨云形成，他們被迫往前飛通過積雨云，但左側機翼箱油漏了，剩下的油不能支撐他們飛到海濱機場。
肖默決定返航宏圖機場，吳迪和夏宇都很意外，一旦返航，這趟等同于沒飛，那肖默的復飛也泡湯了，但肖默說安全重要。此時，塔臺聯系不上B10YT，但可以看得到他們正在下降高度返航。陶山和任遠都猜測，他們會不會遇到了什么突發情況。后來，B10YT安全返航。經過所有教官的評定，吳迪這次轉場飛考核滿分，加上之前的成績，她排在年級第3名，入圍獎學金名單。所有人都通過轉場飛考核，拿到了CPL商業駕駛執照。眾人為此開始歡呼雀躍，夏宇興奮在吳迪臉上親了一下，被吳迪狠狠地瞪了一眼。
任遠恭喜肖默，他終于可以復飛了。肖默卻因為夏宇親吳迪那一下，而顯得有些不開心。第二天，夏宇再次向吳迪表白，但吳迪說自己在考上飛行員之前不考慮談戀愛，而且她的男朋友一定要是飛行員，夏宇發誓說自己也一定會當上飛行員。華欣和同事下了飛機，無意中聽到有一架小飛機的飛行員在廁所摔傷手臂，剛好那架小飛機要載一個孩子去做手術，時間十分緊急。工作人員查了一下，現在沒有飛行員可以飛，華欣想到了任遠。在華欣的勸說下，任遠同意飛這一趟。
吳迪讓肖默幫自己剪衫，肖默順她的意在上面寫下一些祝福的話，吳迪心情雀躍，嘴角忍不住揚起。華欣已經和任遠和好，他們的關系進入了一個新階段。仲夏航空第15屆學員畢業典禮上，韓立偉過來慶祝他們畢業，吳迪、夏宇等人終于順利從蔡校長手中接過畢業證書。畢業典禮上，肖默帶朵朵來和大家見面，夏宇借著這個機會當眾向吳迪表白。任遠再度回歸，飛行部的林總說，當初自己沒接受任遠的辭呈是正確的。夏航說，他想成立一個航班專門帶那些患病的孩子實現他們的飛行夢，這也是已故妻子的愿望。
夏航希望這個航班由任遠來總指揮，任遠答應，他還打算帶上A班的學生，這對于他們來說也是一個很好的鍛煉機會。得知吳迪也報名了這次義務飛行，夏宇去找自己的老爸要求參加，夏航讓他去找凱總。夏宇為了飛這趟，他卑微地求凱總，他什么都愿意做，后來，夏宇就以歡樂大使的身份和他們一起飛塞維利亞。
吳迪和肖默一起坐電梯，再一次被困在電梯里，吳迪吐槽一遇到他就沒好事，電梯恢復正常，吳迪從電梯里走出，肖默叫住她說明天飛機上見。第二天，那些患病的孩子紛紛登機，夏宇好聲勸說其中的一個孩子康康系好安全帶，但他覺得飛機上機長最大，他只聽機長的話。隨即，肖默的聲音在廣播里響起，康康二話不說就立刻系好安全帶，讓夏宇很是無語。吳迪提醒他作為歡樂大使，一定要時刻面帶笑容。飛行進行到半，肖默發現康康的飛機模型壞了，他主動幫康康修好飛機模型。
第二天，飛機正常行駛中，開啟了自動駕駛后，任遠去上洗手間，駕駛艙里只有吳迪和肖默兩個人。當時正好是清晨，他們在駕駛艙里看到非常美妙的日出場景，肖默說，等她當上機長，會經常看到這些美景。西班牙，塞維利亞，異域風情在這里非常明顯。機組人員下飛機后就自由活動，羅東安排好那些小孩，夏宇則帶吳迪去玩。吳迪想叫上肖默一起，但夏宇沒同意，直接拉著她走了。杜葳要和他們一起吃飯，偶遇肖默，問他要不要一起，肖默婉拒，他說自己想去河邊走走。
吃飯前，夏宇再次向吳迪表白，吳迪表示自己自始至終都只是把他當做好朋友。吳迪吃飯的時候心不在焉，杜葳作為她的閨蜜，怎么會不知道她那點小心思，便把肖默在基維爾河的事告訴了吳迪。吳迪發信息給肖默，讓他等會兒在那里等自己。吃完飯后，三人一起去基維爾河，杜葳故意找借口拉走夏宇，讓肖默和吳迪獨處。等他們找到手機后跑去河邊，船已經開了。看著遠去的船，夏宇氣不打一處來，總覺得杜葳是故意的。吳迪想拜肖默為師，以后有什么不懂的問題都可以請教他，肖默答應了。
上岸后，吳迪讓肖默陪自己去找一個老朋友。吳迪的這位老朋友叫小方，小方介紹妻子索菲婭和他們認識，說來，當初還是吳迪鼓勵小方追求索菲婭的。看完老朋友后，吳迪和肖默還度過了很愉快的一段時間，吳迪沒想到肖默不僅飛行技術超高，對于扇語也有了解。很快就到了返程的時間，任遠給機會讓肖默做復飛后的第一次降落。肖默回到家，發現朵朵給他留了一封信，朵朵沒有通知肖默就自行搬了出去，她說自己已經長大，不能再依賴肖默照顧自己，但畢竟朵朵在這里人生地不熟，肖默總還是有些擔心的。
夏航讓夏宇以后一定要當上民航機長，他還要放下對所有人的成見。夏宇答應，但唯獨對肖默不行，夏航想為肖默解釋，但話到嘴邊他還是沒能說出來，現在的夏宇還是不夠成熟，夏航也許知道現在不是最好的時機。仲夏航空的退休機長何軍，返聘回來給他們做模擬機的總訓練機長，他很嚴格，讓他們所有人在兩個星期內掌握所有課程。
肖默向何軍打招呼，何軍這次是受邀回來帶那幫剛從航校畢業的學生學習模擬機。肖默邀請何軍用模擬機帶自己飛一趟。肖默選擇的模式是雷雨云，這個模式難度有點大，何軍建議從上層繞過去，但肖默想試試看能不能穿越，結果就是他們“機毀人亡”了，肖默不禁有些沮喪。事后何軍問他為什么想要穿越雷雨云，肖默想的是，如果當時技術夠好，飛機能及時降落，夏太太是不是就不會死。何軍表示，他比任遠更追求完美，所以他承受的壓力比任遠的要大，但過度的壓力反而成了阻力。
以薩利機長舉例，很多人只看到了薩利機長救下了整機人，卻沒看到薩利用自己超強的技術和心理素質化解困難的能力。怕什么來什么，你越想著壓力，壓力就越是會纏著你。肖默獨自在樓頂上想著何軍剛才說的話，背書背得頭昏腦漲的吳迪上樓頂正好看到他。兩人聊了幾句后，肖默就下去了。吳迪繼續回到教室背書做題，夏宇覺得無聊至極，想叫吳迪一起去吃飯，被吳迪拒絕后百無聊賴地看著書，看著看著他就睡著了。其他人都離開了教室，只留下夏宇一個人做白日夢。他夢到自己贏過了肖默，還得到了吳迪的青睞。
羅東看到他傻笑，拿著手機拍下他傻笑的模樣，夏宇勒令他不許將照片發出去。肖默和吳迪再一次乘坐電梯回家，他叫住吳迪，讓她考試加油。華欣告訴大家，今天飛的這班有夏航董事長，還有雷副主席，所以大家要打起精神。有一架運送器官的飛機出了問題，剛好肖默這架飛的也是北京，于機長決定臨時接收，所以延誤了不少時間。為了能盡快到達北京，肖默和塔臺申請直飛。此時，任遠得知于機長和肖默執飛的飛機出了狀況，于機長手受傷，由肖默執飛，并且不返航，任遠很擔心。
飛機遇到強氣流顛簸，華欣作為乘務長，她通過廣播安撫乘客的情緒。顛簸期間，保溫箱發生破損，保溫效果快不行了，華欣趕緊將這個消息告訴兩位機長。前方有兩片雷雨云，肖默想盡快離開這片區域，決定向管制申請從這兩片雷雨云中穿過。任遠這邊也得知，肖默他們被兩片雷雨云夾擊，肖默打算從兩片雷雨云區中間飛過去。幸虧肖默技術過硬，終于安全開著飛機穿過了兩片危險的雷雨云，飛機重新恢復平穩。任遠得知后，終于放下了懸著的心。下飛機前，夏航還特地去看了一眼肖默。
任遠后來為這事說了肖默幾句，但兩人的討論沒有任何的結果。杜葳告訴吳迪，肖默執飛的那輛飛機被雷擊中，吳迪立刻上樓去慰問肖默。吳迪問了他今天執飛的感覺，她希望自己能成為像他一樣飛得那么好的人。末了，肖默將自己的學習筆記送給吳迪，祝她考試順利。因為肖默運送器官及時，那家人感謝肖默，肖默以還有工作為由拒絕采訪。夏宇想過去出風頭，結果卻是丟人，他躲在夏航的辦公室不敢出去，夏航走進來說他。