游馬收到真月的緊急聯絡，趕了過去。想不到真月在跟巴利安以決斗交戰。那名巴利安名叫貝庫塔(ベクター，原型フェクダ/天璣)，在不分勝負的情況下就脫身了。據說他是困擾真月等「巴利安守護者」多年的最兇惡的巴利安。盡管那種巴利安的出現令人緊張，但是游馬終于還是和貝庫塔以決斗對峙！而且，據說他倆以前就有過對決，又是怎么回事……！？

作為自己的替身，游馬因被兇惡的巴利安·貝庫塔奪走真月，大受打擊。而星光則從消失的貝庫塔那里收到「No.66?霸鍵甲蟲（No.66?覇鍵甲蟲マスター?キー?ビートル）」的卡，并從這張卡感覺到不可思議的力量。就在那種時候，快斗和鯊魚趕到游馬這里來，他們在得知這起事件是和巴利安有關之后，本想馬上闖入巴利安世界，可惜一直沒找到那個方法。

游馬他們靠「異次元飛船」來到「サルガッソ(死域海，取自サルガッソ海/馬尾藻海)」，而等著他們的是貝庫塔等巴利安。然后，對貝庫塔的憤怒達到頂點，游馬開始了決斗。與此同時，快斗vs米扎艾爾，以及鯊魚vs德魯貝的決斗也在此開始！這「死域海」被謀劃好的場地魔法「異次元の古戦場(異次元的古戰場)」，不斷地削去游馬他們的LP。游馬的身心已經受創，可是貝庫塔還搬出沖擊性的事實，更進一步展開追擊！