里瑟跟蹤著“號碼”孔——一名國際商人，他本應該坐飛機到倫敦，卻在中途因身體不適來到了急診室，醫生診斷孔得了流感并給他注射抗病毒劑治療他的病情。弗??斯科前往安全屋找卡爾尋求調查線索。孔在注射抗病毒劑后，死在了急診室，醫生們采取了緊急隔離措施，芬奇也趕來幫忙。

孔的血檢結果顯示他來急診室前就已經感染了禽流感，在醫生給他注射活性人流感病毒后兩種病毒融合產生了一種高致命高傳染性的新病毒！根通過調查發現給孔注射的那批抗病毒劑在運輸的途中被更改線路運送到了一間實驗室，顯然是有人制造了這起疫情。根讓“機器”分析了孔的血樣，在運行了五萬億次后才模擬出殺死孔的那種病毒的染色體，而能擁有同樣計??算能力的只有一位——“撒馬利亞人”。

最后“機器”分析出了治療疫情的抗體藥劑阻止了病毒的蔓延，但疫情過后，疾病控制及預防中心建議所有人接受體檢以便??政府確定誰需要注射疫苗，然而這一切都是“撒馬利亞人”為了采集人們DNA的行為，一場陰謀似乎正在醞釀著…