《大明醫(yī)圣李時(shí)珍》講述了我國(guó)明朝偉大的醫(yī)藥學(xué)家李時(shí)珍（公元1518年-1593年）富有傳奇色彩的一生和跌宕起伏的情感歷程。 正德十六年，武宗駕崩，朱厚熜即位，建元嘉靖。李言聞被封為太醫(yī)院吏目。 李言聞好友吳藥師因治錯(cuò)小郡主的病，被關(guān)入牢中。吳藥師臨終托孤，將女兒吳斯語(yǔ)許配給李時(shí)珍。 長(zhǎng)大后李時(shí)珍進(jìn)陽(yáng)明書院學(xué)習(xí)，和荊王府世子朱成翊成為同學(xué)。朱成翊希望拉攏李時(shí)珍為自己所用，卻被李時(shí)珍嚴(yán)詞拒絕。朱成翊遂與李時(shí)珍成了死對(duì)頭。 李時(shí)珍偶遇一個(gè)美麗的少女朱萇葶，卻發(fā)現(xiàn)她脈象異常，命不久已。李時(shí)珍給她治療多年頑癥，兩人產(chǎn)生愛(ài)慕之情。一次偶然的機(jī)會(huì)，李時(shí)珍發(fā)現(xiàn)少女居然是荊王府郡主。 李時(shí)珍希望能考取功名，得個(gè)一官半職，與萇葶也不是不可能。朱成翊得知李時(shí)珍趕考，便派人買通主考官。 李時(shí)珍被考官誣陷舞弊，趕出考場(chǎng)。李時(shí)珍心結(jié)郁積，一病不起。 萇葶暗中派人送信與李時(shí)珍商量私奔，得不到任何回應(yīng)，失望之余病情加重，也臥倒不起。荊王急忙下令要李言聞替女兒看診，可是李時(shí)珍命在旦夕，李言聞根本無(wú)法離開(kāi)。危急時(shí)刻，斯語(yǔ)出面坦承自己的藥膳是治療郡主的關(guān)鍵，立下生死狀，進(jìn)入荊王府救治萇葶。 成翊要求斯語(yǔ)留在自己身邊，在王府享受榮華富貴，被斯語(yǔ)拒絕。 李時(shí)珍終于和斯語(yǔ)完婚，并且跟隨父親正式開(kāi)始行醫(yī)。 李時(shí)珍經(jīng)過(guò)幾輪考試，終于進(jìn)入太醫(yī)院。 此時(shí)朱萇葶拜道士陶仲文為師，整日沉迷于煉丹食丹不能自拔；而藍(lán)行義則和已成為楊妃的楊雪英勾結(jié)，利用所學(xué)醫(yī)術(shù)，在后宮興風(fēng)作浪；朱成翊也來(lái)到京城，和嚴(yán)世蕃勾結(jié)一氣；景王和裕王爭(zhēng)奪太子之位，嚴(yán)嵩和徐階兩派政治斗爭(zhēng)激烈。李時(shí)珍卷入這波瀾詭譎陰謀重重的宮廷斗爭(zhēng)之中……