清朝康熙年間，忠臣何大人被將軍杞獻唐(朱鐵和)陷害，遭朝廷抄家其妻及女兒玉鳳(黃杏秀)及時逃脫。玉鳳為救父親，勇闖法場，連傷十三人，但終不敵受傷，因此被江湖中人稱為十三妹。?另一忠臣安大人(陳有后)亦遭抄家，唯其子驥(湯鎮業)逃出生天。驥與玉鳳自小青梅竹馬，二人結伴逃亡。期間，他倆與眾人巧遇玉格格(翁美玲)，九難師太(李琳琳)認出玉格格乃康熙(楊澤霖)之胞妹，欲利用她，以行刺康熙。玉格格不知其身份已被識穿，更愛上女扮男裝之玉鳳，后遇上名醫李妙生(任達華)，她才轉投其懷抱。?紫薇(楊盼盼)受其父杞獻唐之命，混入玉鳳等人中作臥底，卻與驥日久生情。此時，康熙南下出巡，九難師太準備行刺康熙；杞獻唐亦布下天羅地網，欲把玉鳳等人一網成擒．．．．