在巨石碑崩塌之前，蓮太郎等人還是像平常一樣生活。為了分散注意力，蓮太郎仍是前去幫外圍區(qū)的“受詛之子”上課，并帶她們去參觀“回歸之炎”，告訴她們回歸之炎代表的意義，并察覺到，宿畢五攻擊32號巨石碑，似乎有什麼特別的義意。在那同時，因為人們憎恨原腸動物，繼而牽怒“受詛之子”，街上開始有人想要攻擊“受詛之子”，到最後甚至用炸彈攻擊外圍區(qū)??????。

保衛(wèi)巨石碑的戰(zhàn)爭開始了，里見等人和其他民警輔助部隊一起投入戰(zhàn)場。戰(zhàn)斗中，里見他們發(fā)現有一支原腸動物的分隊可能會對他們形成夾擊，卻沒有其他人發(fā)現，於是里見無奈之下只好帶著他的輔助部隊擅自離開大隊前去檄滅那個分隊。結果卻間接導致我堂團長的兒子死亡，我堂團長公報私仇，要里見獨自一人去擊殺畢宿五的左右手－－會用水銀攻擊的原腸動物“昴宿星團”。

在蛭子影胤的幫助下，里見蓮太郎成功找到昴宿星團，并且和影胤聯手消滅了它。但畢宿五也開始遷移，圣天子的火力支援下，仍也無法摧毀擁有不死之身的畢宿五。而當蓮太郎回到營地時卻發(fā)現我堂團長已死，根據規(guī)定，將由下一個IP排行最高的人接任團長之職，而那人就是－－蓮太郎。蓮太郎將最後決戰(zhàn)的地點定在“回歸之炎”，他能帶領輔助部隊順利消滅畢宿五，拯救東京地區(qū)嗎？