藤丸和音彌懷疑，在俄羅斯發生的病毒恐怖主義事件：“圣誕節的虐殺”的錄像中所出現的神秘女子，就是他們學校新來的生物老師折原瑪雅。為了確認這個推測的真偽，兩人結伴潛入了瑪雅老師的公寓。音彌負責把瑪雅老師騙出去，而藤丸則設計再次潛入她的公寓，找到了暗房里的電腦并將數據拷貝下來。但瑪雅也意識到事情有變而趕回家來。終于露出真面目的瑪雅掏出手槍對準了藤丸。就在千鈞一發之際，THIRD-i的狙擊手射中了瑪雅，救下了藤丸。

THIRD-i逮捕了瑪雅，并對她實施了嚴苛的拷問。但瑪雅卻完全不屈服，完全沒有招供的意思。但是她提出，如果帶藤丸跟著同行，她可以帶著他們去他們的老巢。

藤丸和加納，寶生一起上了車，與瑪雅前往他們的根據地。結果在路上，瑪雅又說出了讓大家非常驚訝的話：同車的人里有他們的同伴。究竟誰才是那個叛徒！？藤丸究竟該相信誰？車里的空氣凝重而不安起來。而瑪雅堅持把藤丸帶去基地的目的又是什么？?與此同時，一個神秘的男人正在向藤丸等人靠近。