石原爾因為擅自調動部隊，準備以死謝罪的時候，被趕來的中村太郎及時制止。石原爾遵照中村太郎的指示前往新京總部接收審判。在關玉格格的細心照料下，蘇海龍和張婉婷的傷勢恢復的特別快。秦牛等人也被關玉格格我行動所感動，對關玉格格的態度也有所緩和。蘇海龍的部隊經歷了棋盤山的戰斗以后，猶如涅槃的鳳凰得以重生，蘇海龍從新整合部隊正是加入東北抗日聯軍。蘇海龍的部隊經過從新整編以后作為獨立團編入第五軍，在戰斗中蘇海龍的部隊戰斗勇猛，很大程度上震懾了敵人，皇協軍李兆新的部隊，在與抗聯的戰斗中多次配合蘇海龍，將手中押運的戰備物資送給抗聯的部隊。日軍高層得知此事以后，為了防止李兆新的部隊投靠抗聯，表面上以巡視工作為名，實際是監視李兆新的一舉一動。經過周保國的詳細研究，決定盡全力爭取李兆新的部隊加入抗聯，這個重要的任務交給了張婉婷。在于李兆新的接觸中，張婉婷初步與李兆新達成了接應的時間和地點。蘇海龍所領導的獨立團做為首選部隊負責接應和掩護李兆新的部隊，當日軍察覺到李兆新有投靠抗聯的舉動的時候，派出部隊進行圍追堵截。張婉婷和關玉格格始終沖在戰斗的第一線上。在戰斗中張婉婷為了救關玉格格壯烈犧牲，李兆新的部隊得以安全撤出戰斗。蘇海龍快馬加鞭趕來迎接張婉婷，看到的確實張婉婷冰冷的尸體，蘇海龍悲痛萬分，坐在張婉婷的墓前久久不愿離去。

田中隆吉通過軍部的關系，讓石原爾提前出獄，留在新京接替自己，全面接管特高課的諜報工作，并且首要的任務就是，為了在東北地區籌建第100部隊，要保護著名細菌專家大宮一郎，安全抵達新京。由于，日軍在正面戰場頻繁的使用大規模的細菌武器，東北抗日聯軍的非戰斗減員十分嚴重，正當周保國等人急切的尋找解決辦法的時候，接到黨組織的命令，讓蘇海龍成立行動小分隊，前往新京配合共產國際成員截獲疫苗配配方，粉碎第100部隊的建立。中村太郎利用自己的諜報網絡，成功的將潛伏在新京的共產黨小隊全部消滅，并且部下了眾多的監視網，靜靜的守候著蘇海龍小分隊的到來。蘇海龍等人相繼進入新京，入住松鶴酒店。但是蘇海龍等人的一舉一動都在石原爾的掌握之中，蘇海龍安頓好關玉格格等人以后，就前往居酒屋與共產國際成員劉子健會面。蘇海龍經過劉子健的介紹以后得知此次行動的只要目標就是在新京大飯店出現的大宮一郎手中珍貴的疫苗配方，有了疫苗配方就能徹底解決東北抗日聯軍的非戰斗減員。蘇海龍根據劉子健提供的情報，讓孫二斤、小蜜蜂和小蝴蝶三人化裝成賓館服務員預先進入到新京大飯店內部，配合自己和關玉格格執行任務。與此同時復興社新京站的曾紹華也接到上級的指示，派出自己的得力干將曾孝明，帶領行動小分隊前往行經郊外襲擊大宮一郎，搶險拿到疫苗配方。曾孝明根據所掌握的情報，在新京郊外對大宮一郎的車隊發起攻擊，但是當曾孝明等人打開密碼箱以后，發現里面并沒有什么疫苗配方。

蘇海龍等人的行動進展十分順利，蘇海龍成功在大宮一郎的保險柜內拿到了疫苗的生產地點的平面圖紙，眾人決定盡快行動拿到疫苗配方。真正的大宮一郎坐在車內，反復的查看著自己手中的疫苗配方，正當大宮一郎洋洋得意的時候，一群神秘人對車隊發起攻擊，大宮一郎被殺，真正的疫苗配方被搶走，從此下落不明。石原爾的得知大宮一郎被殺，疫苗配方下落不明以后，命令中村太郎暗中進行追查，盡快找到疫苗配方的下落。正當所有人都在尋找疫苗配方下落的時候，疫苗配方已經在復興社成員張天宇的手中。原來此人掌握到大宮一郎的真實行蹤以后，并沒有馬上進行上報而是擅自暗中行動，打算將疫苗配方在黑市進行出售換取更多的金錢。張天宇利用手許二彪將已經截獲的疫苗配方交給自己的合伙人劉掌柜，張天宇則將手下全部殺死從此消失準備與劉掌柜匯合共同前往新京，將手中的疫苗配方換成美元。蘇海龍等人整裝待發前往生產疫苗配方的倉庫，準備卻去疫苗配方。但是石原爾和中村太郎早有準備，正當蘇海龍等人準備行動的時候，大批的日軍士兵從四面八方涌現出來，蘇海龍等人在于日軍士兵的激戰過程中，小蝴蝶為了保護關玉格格不幸犧牲。蘇海龍等人只能分散進行突圍。當張天宇前來與劉掌柜見面的時候，發現劉掌柜竟然帶著疫苗配方消失的無影無蹤，張天宇萬般無奈之下只能前往新京查找劉掌柜的行蹤，希望在劉掌柜將疫苗配方出手之前將其截獲。暫時脫離危險的蘇海龍等人一直沒有杜三、秦牛和姜峰的下落，蘇海龍認為此次行動完全就是敵人預先設計好的一個圈套，然而目前來看嫌疑最大的就是劉子健，蘇海龍決定找到劉子健一探究竟，為死去的小蝴蝶報仇雪恨。蘇海龍在于劉子健的交談中得知，此次行動劉子健也是剛剛知道整件事情是一個圈套。