高中二年級學生真夏大地在暑假開始前的晚上，在電視上目睹了種子島上空突如其來的不可思議的圓形虹光。曾經見過這種虹光的大地內心洶涌澎湃，決定一個人向著種子島進發。“父親因事故而死亡的謎題”、“幼年時遇到過的不可思議的少女的記憶”等復雜思緒從胸口涌出。到達種子島的大地因某設施的報警聲而與“EarthEngine”相遇。“你就是隊長嗎…”伴隨著詢問聲，大地看到的是從天王星襲來的謎之完全機械生命體“KILL-T-GANG”，少年的冒險也在這絢爛星空中拉開帷幕。

真夏在未經通報的情況下駕駛機器人“地球號”出動，基地眾人驚訝中迎擊“KILL-T-GANG"來襲，但是由于沒有經過任何訓練，遭受到了機械生命體的重創，這時博士緊急調用一神秘黑客侵入導航系統，間接控制住機體，輔助迎擊。在黑客神秘聲音的配合下，真夏大地終于擊退來犯的機械生命體，并回到基地。在基地中，真夏以外的遇到了幼時遇到的神秘少年（嵐徹平）與被他喚醒的神秘少女（夢塔花），只是二人的處境似乎并不太妙，而且真夏也將面臨同樣的處境。在方舟派針對迎擊派的陰謀中，真夏將如何面對呢？

神秘黑客登場，居然是基地司令5年未見的女兒——夜祭明，并且似乎暴露了一段司令的糟糕私生活？自由了的徹平和花與夜祭明真夏一起住進了司令家中。幾天后新的敵人來犯，方舟派的salty?dog為了陷害真夏而向真夏透露來犯者是他的殺父仇人。本應被禁止出擊的真夏在方舟派的慫恿下出擊，然后還未維修的破敗機體幾乎導致全敗的局面，就在真夏危機的時刻，徹平和花聯手出動了，他們的真實身份到底是什么呢？